發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：青海
-
教你用科學(xué)雜志喜歡的配色作圖——R包ggsci
ggsci是ggplot的主題包锄禽，它提供一系列高質(zhì)量的調(diào)色板枝恋，其靈感來(lái)自于科學(xué)期刊练链、數(shù)據(jù)可視化庫(kù)、科幻電影和電視節(jié)目中使用的顏色。ggsci中的...
-
轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)分析—ballgown
ballgown是一個(gè)差異表達(dá)分析RNA-Seq數(shù)據(jù)的R包 對(duì)數(shù)據(jù)的要求： 1. RNA-Seqreads應(yīng)已比對(duì)到參考基因組上睛藻。 2.轉(zhuǎn)錄組應(yīng)...
-
NGSQC Toolkit(轉(zhuǎn)錄組分析之data cleaning）
NGSQC Toolkit用于進(jìn)行高通量測(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量檢查和數(shù)據(jù)過(guò)濾启上，具有去接頭，去除非ATGC堿基店印，去除低質(zhì)量堿基和reads等功能 1安裝 ...
-
Multiqc（轉(zhuǎn)錄組分析之質(zhì)量評(píng)估）
fastqc是一款基于java的軟件冈在，能夠?qū)y(cè)序數(shù)據(jù)的質(zhì)量進(jìn)行評(píng)估。一個(gè)樣本生成一個(gè)報(bào)告按摘，當(dāng)樣本量過(guò)多時(shí)包券，逐一查看樣本質(zhì)量就稍顯不方便，mult...
-
用vmd將gromacs軌跡轉(zhuǎn)換為動(dòng)畫(huà)
1 壓縮gromacs的trr軌跡文件 #因?yàn)閠rr格式的軌跡文件包含軌跡 坐標(biāo)x, 速度v和力f的信息(二進(jìn)制, 全精度, 可移植)炫贤，因此占用...
-
kraken軟件操作手冊(cè)
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量分析完溅固，想拿kraken軟件分析下數(shù)據(jù)有沒(méi)有微生物的序列污染 找了全網(wǎng)沒(méi)看見(jiàn)什么相關(guān)的指導(dǎo)文章，看官網(wǎng)的操作手冊(cè)也很雞助兰珍，所以自己...
-
轉(zhuǎn)錄組分析文章筆記Transcript-level expression analysis of RNA-seq experiments with HISAT, ...