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前段時間,發(fā)表了一篇葉綠體基因組比較分析文章。盡管這類套路文已經(jīng)不再熱門,但在準(zhǔn)備數(shù)據(jù)分析的過程中,仍感各種資料教程之零散,各種文章的做圖工具也...
1 葉綠體的組裝 1.1 GetOrganelle的安裝 此處默認(rèn)Anaconda已經(jīng)安裝歇竟,那么使用下面的命令即可安裝GetOrganelle:...
1. 前言 構(gòu)建一棵系統(tǒng)發(fā)育樹是研究系統(tǒng)學(xué)和進(jìn)化的基礎(chǔ)。然而抵恋,發(fā)育樹的構(gòu)建是對分類單元進(jìn)化歷史的推測焕议,因此對發(fā)育樹的可靠性檢驗(yàn)也是重中之重。一棵...
近期弧关,由于個人文章需要在小地理范圍地形圖上標(biāo)注采樣點(diǎn)盅安,即一個精準(zhǔn)位置標(biāo)注的采樣示意圖唤锉。之前在中國地圖上直接手動粗糙地標(biāo)注采集點(diǎn)的方法已經(jīng)難以滿足...
介紹使用BAPS推斷群體遺傳結(jié)構(gòu)的具體方法。BAPS與STRUCTURE類似宽堆,都是基于哈溫平衡假設(shè)和貝葉斯推斷來估算個體的遺傳聚類(K)歸屬腌紧。該...
本篇文章是為了記錄本人在系統(tǒng)發(fā)育實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析過程中,所使用過的以及部分未使用但如雷貫耳的軟件的集合畜隶。當(dāng)然,相對于整個系統(tǒng)發(fā)育軟件之汪洋大海号胚,此...
本文章意在列舉一些植物分類學(xué)研究過程中常用的互聯(lián)網(wǎng)在線資源籽慢。 1. 植物志 1.1 國內(nèi)植物志 中國植物志[http://frps.iplant...
介紹Consel系統(tǒng)發(fā)育檢測軟件的使用教程。 1. 簡介 系統(tǒng)發(fā)育是一種歷史過程猫胁,任何基于分子數(shù)據(jù)集得到的發(fā)育樹都是對真實(shí)系統(tǒng)發(fā)生的推測箱亿。一個合...