240 發(fā)簡(jiǎn)信
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    snpEff使用說(shuō)明(下)-SnpEff注釋SNP/INDEL

    上一期丛版,給大家介紹了SnpEff注釋數(shù)據(jù)庫(kù)术徊。這一期著重介紹SnpEff的命令,最后一期介紹注釋結(jié)果解析 準(zhǔn)備文件已經(jīng)注釋好的物種SnpEff注釋...

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    snpEff使用說(shuō)明(上)-了解及創(chuàng)建SnpEff注釋數(shù)據(jù)庫(kù)

    SnpEff是一款注釋變異位點(diǎn)(SNP+InDel+MNP)和預(yù)測(cè)變異對(duì)基因的影響(例如氨基酸變化)的工具鹤盒。 用法: 輸入文件:輸入是變異位點(diǎn)(...

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    R繪制火山圖 EnhancedVolcano+ggplot

    什么是火山圖? 火山圖其實(shí)是一種很形象的叫法嚷兔,它可以通過(guò)關(guān)注對(duì)象的落點(diǎn)從而直觀地展示該對(duì)象的所屬區(qū)域复亏。其通常用于展示差異結(jié)果,比如RNA-seq...

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    pheatmap 相關(guān)性熱圖 基因表達(dá)量熱圖

    熱圖 熱圖概念:熱圖是一個(gè)以顏色變化來(lái)顯示數(shù)據(jù)的矩陣椅文,可以簡(jiǎn)單地聚合大量數(shù)據(jù)喂很,并使用一種漸進(jìn)的色帶直觀地展現(xiàn)空間數(shù)據(jù)的相對(duì)大小。 熱圖在生物學(xué)中...

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    clusterProfiler基因功能富集分析 +氣泡圖

    1. 非模式生物 非模式生物需要提前從AnnotationHub抓取目標(biāo)物種的OrgDb數(shù)據(jù)庫(kù)皆刺,這個(gè)庫(kù)里包括Uniport少辣,ENSEMBL,EN...

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