240 發(fā)簡信
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    芯片數(shù)據(jù)和RNA-seq的差異分析流程

    由于太久沒有分析過bulk數(shù)據(jù)了衣吠,前幾天突然被要求分析一個文章的數(shù)據(jù)時有點亂了手腳稳析,所以在這里想總結(jié)一下關(guān)于芯片數(shù)據(jù)與seq數(shù)據(jù)的差異分析流程库车。...

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    CIBERSORT:反卷積推測bulk中的細胞類型

    五一學(xué)了一個新的分析方法-CIBERSORT享甸,這個包其實很早就想學(xué)的,因為現(xiàn)在一般的單細胞文章的套路,很難不用到它,那么它能干什么呢?它能夠推測...

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    單細胞差異基因展示圖

    最近看到一個公眾號讥蔽,分享了一個圖片涣易,公眾號的名字為西紅柿的空間轉(zhuǎn)錄組,代碼均來著這個公眾號冶伞,廢話不多說新症,先看看圖長什么樣 直接上代碼 加載數(shù)據(jù)與...

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    ComplexHeatmap:在熱圖上把基因標(biāo)記出來

    今天給大家介紹一個很強大的包,這個包我也是只是學(xué)了冰山一角响禽,更多的功能還是需要多查一些資料徒爹。想必大家看文章經(jīng)常看見這種比較漂亮的圖片吧 哦豁芋类,這...

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    Monocle3:擬時序分析

    寫在前面:今天突然想寫這個教程隆嗅,花了一下午看資料,其實我前面是有一些基礎(chǔ)的侯繁,但是看的還是會很亂胖喳,所以想把這個包的脈絡(luò)寫一下,希望能夠可以跟大家討...

  • SCENIC-轉(zhuǎn)錄因子分析

    今天寫一篇關(guān)于單細胞轉(zhuǎn)錄因子的分析-scenic在做分析之前你應(yīng)該看一下這篇文獻贮竟,看看別人做了什么scenic分析《Single-cell RN...

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    Rcis Target:基因集找其調(diào)控因子和motif

    寫在前面:今天學(xué)習(xí)了Rcis Target這個包丽焊,每一次在學(xué)習(xí)一個包之前较剃,苦惱和痛苦是不知道這個R包用來do for what?why to d...

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    簡書創(chuàng)作

    淺顯的簡書創(chuàng)作格式的講解技健,適用人群為想在簡書上寫/分享代碼的好同學(xué) 1.理解簡書的兩種編輯器 簡書有兩種編輯器写穴,一種是富文本編輯器,還有一種是M...

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    AUCell:單細胞轉(zhuǎn)錄組中識別每一個細胞對某個通路的富集程度

    AUCell:能夠看出某個通路在細胞中的激活情況雌贱,在文章中可以用于差異比較啊送,即這個通路多數(shù)在巨噬細胞中激活,而在其他細胞群中不激活 1.R包的下...

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