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    plink對SNP進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析

    文件 1. 查看數(shù)據(jù) 這里,文件是bed文件,二進(jìn)制不方便查看召烂,我們將其轉(zhuǎn)化為ped文件和map文件 注意讯屈,這里我使用的是ped和map格式利赋,如...

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  • R | transform函數(shù)增刪變量

    函數(shù)transform()作用:為原數(shù)據(jù)框添加新的列添祸,改變原變量列的值艳馒,通過賦值NULL刪除列變量 用法: transform(‘data’,…...

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    單因素分析和多因素分析的結(jié)果不一致

    我們在做統(tǒng)計(jì)分析時拦惋,常常都習(xí)慣了這樣的分析套路:先進(jìn)行統(tǒng)計(jì)描述匆浙,然后做單因素分析,最后再進(jìn)行多因素分析厕妖。在閱讀文獻(xiàn)時首尼,我們也會發(fā)現(xiàn),不管是一般的...

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  • R | 生存分析

    整理下最近看的生存分析的資料 生存分析是研究生存時間的分布規(guī)律,以及生存時間和相關(guān)因素之間關(guān)系的一種統(tǒng)計(jì)分析方法 其主要應(yīng)用領(lǐng)域: Cancer...

  • 畫圖專題 | 差異表達(dá)基因結(jié)果展示系列之柱狀圖

    如何將好幾張功能富集結(jié)果中的柱狀圖的橫坐標(biāo)的范圍全部調(diào)整為一樣的软能? 一般畫這個柱狀圖都是用Y叔的clusterprofiler包中的barplo...

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    R | factor 因子

    factor 因子 在R中數(shù)據(jù)的分類是用因子數(shù)據(jù)類型(factor)來表示的迎捺。如性別。 我們想按照status對患者進(jìn)行分類查排,所以將status...

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    R | 常量凳枝、常量的數(shù)據(jù)類型、變量跋核、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

    一岖瑰、常量 常量是指直接寫在程序中的值。 R語言基本的數(shù)據(jù)類型有數(shù)值型砂代, 邏輯型蹋订,文本(字符串)。支持缺失值刻伊,有專門的復(fù)數(shù)類型露戒。 數(shù)值型常量包括整...

  • set.seed()函數(shù)

    set.seed():該命令的作用是設(shè)定生成隨機(jī)數(shù)的種子,種子是為了讓結(jié)果具有重復(fù)性娃圆。如果不設(shè)定種子玫锋,生成的隨機(jī)數(shù)無法重現(xiàn)。 set.seed(...

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