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Linux中利用MD5值檢測測序數(shù)據(jù)完整性
md5sum命令簡介 md5sum 用于計算和校驗文件的MD5值言蛇，md5sum命令用于生成和校驗文件的md5值鼻忠。它會逐位對文件的內(nèi)容進(jìn)行校驗拒啰，與...
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下載R舊版本更新R到最新版本以后状您，下載包各種報錯脖捻，懷疑是版本問題愈诚，然后下載了舊版的R,問題得到解決荣堰。 下載地址 https://cran.r-project...
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DNA甲基化分析④去重復(fù)＆計算胞嘧啶的甲基化值
1淹辞、去除冗余的reads 結(jié)果： 2荠医、將bam文件轉(zhuǎn)化為sam文件 結(jié)果： 3、計算每個胞嘧啶的甲基化值 結(jié)果：
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DNA甲基化分析③使用bismark比對
1、將參考基因組進(jìn)行重亞硫酸鹽的預(yù)處理轉(zhuǎn)換 結(jié)果： 2彬向、將數(shù)據(jù)比對到已經(jīng)轉(zhuǎn)化了的參考基因組上 一次處理單個樣本： 一次處理多個樣本： ps:--...
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DNA甲基化分析②數(shù)據(jù)質(zhì)控質(zhì)控原則 好的結(jié)果需要好的數(shù)據(jù)兼贡。原始下機(jī)測序數(shù)據(jù)(raw data)中，有些reads包含有測序接頭序列娃胆，這些序列不屬于測序物種中的原有序列遍希，因...
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DNA甲基化分析①數(shù)據(jù)及軟件準(zhǔn)備
（上接Mimiconda的安裝與配置） 1、上傳和下載數(shù)據(jù) 創(chuàng)建WGBS文件夾用來存放測序數(shù)據(jù)和參考基因組序列數(shù)據(jù) 下載參考基因組和注釋文件 G...
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修改Linux命令提示符的顏色
bash背景下 linux命令提示符由“username@主機(jī)名+路徑”構(gòu)成里烦，默認(rèn)的命令提示符顏色為白色凿蒜，我們可以根據(jù)自己的喜好來修改命令提示符...
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Linux新用戶登錄時出現(xiàn)“-bash-4.2$”的解決方法
Linux服務(wù)器新建立的用戶在登錄時顯示“-bash-4.2$”，而不是“user@主機(jī)名+路徑”的顯示方式胁黑。出現(xiàn)的此問題的原因是在添加普通用戶...
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Miniconda的安裝與配置
Miniconda的安裝與配置 1废封、簡介 Conda 是為 Python 程序創(chuàng)建的是一種開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng)，用于安裝多個版本的...