MGCA Microbial genome component and annotation pipeline Introduction The...
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MGCA：微生物基因組組分與注釋管道 -
CAZy碳水化合物活性酶預(yù)測CAZy數(shù)據(jù)庫簡介 CAZy 全稱為Carbohydrate-Active enZYmes Database唆迁，碳水化合物酶相關(guān)的專業(yè)數(shù)據(jù)庫尤蛮，內(nèi)容...
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PGCGAP v1.0.35版本更新
PGCGAP 是用于原核生物基因組學(xué)和比較基因組學(xué)分析管道叽掘，目前該管道包含 12 個模塊，可以接受 Illumina 雙端 reads、Oxfo...
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利用PGCGAP根據(jù)ids提利用PGCGAP根據(jù)id提取序列信息
使用場景 假設(shè)有一個 fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa屁药，我們想要提取其中的一些序列到一個新的文件中，我們擁有這些序列的 i...
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一個神奇的小軟件bioawk劉小澤寫于18.7.29 寫在前面：之前介紹過文本處理的三劍客，grep邻遏、sed、awk虐骑，也曾說過准验，學(xué)了awk，讓一切字符秒變尷尬“awk wo...
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【群體遺傳】Fst（群體間分化指數(shù)）（1）是什么廷没？含義是什么糊饱？ ，全稱為fixation index颠黎，是一種用于衡量群體間分化程度的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)量（由Wright's F-statis...
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神器 | 計(jì)算Non-coding序列選擇壓另锋！KaKs_Calculator 3.0 重磅發(fā)布~寫在前面 早前我在 TBtools 中基于NG86邏輯實(shí)現(xiàn) Ka/Ks 計(jì)算時走了不少彎路，其中種種狭归，或許只有 Coding 的人才知道夭坪。當(dāng)然，...
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聊聊“基因組共線性”最近看了幾篇關(guān)于共線性分析的微信/簡書推送过椎，發(fā)現(xiàn)不少研究人員把“編碼基因共線性”錯誤地描述為“全基因組共線性”室梅。這是兩個完全不同的概念，前者主要...
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GSVA分析
GSVA其實(shí)就是pathway級別的差異分析[http://www.reibang.com/p/8817dbaee8dd]，根據(jù)GSVA[ht...
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按照熱圖聚類結(jié)果來給樣本分組1.需求 如圖亡鼠，熱圖自帶聚類樹赏殃，將樣本(列)分成了三個簇。想要按照聚類的結(jié)果间涵，獲取到 的信息仁热，并將這個信息添加到熱圖上。 2.作圖的數(shù)據(jù) 輸入數(shù)...
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