測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序...

胰腺導(dǎo)管腺癌的五年生存率低于5%艳悔，是目前主要致死的癌癥之一。如何結(jié)合多個(gè)公開數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)分析和挖掘此類癌癥臨床診斷和預(yù)后的關(guān)鍵基因呢猜年？這里就給大家...

0.介紹 本文的數(shù)據(jù)出自2017年的一篇文章：Seven-CpG-based prognostic signature coupled with...

火山圖有誤，已更新 前情提要 前面兩個(gè)步驟已經(jīng)完成了數(shù)據(jù)下載疾忍、探針過濾乔外、數(shù)據(jù)質(zhì)控一罩、樣本過濾杨幼。 此處需要補(bǔ)充兩個(gè)知識(shí)點(diǎn)： beta值的生物學(xué)意義 ...

在step1中，我們獲得了TCGA中OSCC 的32個(gè)病人的T-N配對(duì)樣本和對(duì)應(yīng)的臨床信息,并將其組成了一個(gè)名為my_Load的ChAMP對(duì)象差购。...

4.將差異甲基化位點(diǎn)拿來做批量生存分析 logrank test批量生存分析 這里和TCGA系列里的內(nèi)容是一樣的，詳見：兩種方法批量做生存分析 ...

TCGA數(shù)據(jù)的另一個(gè)重要的包：RTCGA參考學(xué)習(xí)資料：TCGA之miRNA預(yù)測(cè)臨床表現(xiàn)RTCGA（1） 數(shù)據(jù)概況與數(shù)據(jù)下載RTCGA（2） 數(shù)據(jù)...

TCGA是研究腫瘤相關(guān)機(jī)制的重要資源找蜜。在線數(shù)據(jù)庫(kù)更新改版都比較快，使用時(shí)需要參照最新的線上數(shù)據(jù)教程稳析。不過癌癥相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)操作起來也都比較類似洗做，輸...