經(jīng)歷之前的三節(jié)忌怎，現(xiàn)在大家手上已經(jīng)有了從NCBI或者ENA數(shù)據(jù)庫(kù)下載好并轉(zhuǎn)化成了Fastq格式的文件（可以看到我這里只有單端測(cè)序的文件籍滴，應(yīng)該是這個(gè)...

安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運(yùn)行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_6...

共線性：物種間的共線性是由于物種間產(chǎn)生分歧，從同一祖先繼承來(lái)的遺傳信息經(jīng)過(guò)各自的進(jìn)化后榴啸，仍保留了大量的高度相似序列孽惰。分析：通過(guò)基因/基因組序列基...

寫在前面 前天燎竖，我寫了一個(gè) TBtools 插件，意在讓所有人都能自主分析轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)要销，進(jìn)而獲得 基因表達(dá)量矩陣（TPM） 和 基因讀段計(jì)數(shù)矩...

我們已經(jīng)得到了一個(gè)表達(dá)矩陣构回，下面我們就用DEseq2篩選差異表達(dá)基因，并進(jìn)行簡(jiǎn)單的visulization疏咐。 DESeq流程 第一步我們需要準(zhǔn)備...

將染色體從contig/scaffold水平提升到chromosome水平是組裝的最終目標(biāo)纤掸。我們通常使用遺傳圖譜，光學(xué)圖譜浑塞，HiC這些技術(shù)提供的...

根據(jù)已有的蛋白庫(kù)借跪，對(duì)從基因組上提取到的蛋白序列進(jìn)行比對(duì)，從而獲得相應(yīng)的信息酌壕。 常用的數(shù)據(jù)庫(kù)： Nr：NCBI官方非冗余蛋白數(shù)據(jù)庫(kù)掏愁，包括PDB, ...

10.UpSet集合圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 使用UpSetR包繪制集合圖 基礎(chǔ)繪圖 使用set.metadata參數(shù)添加元數(shù)...

Let PCA tell us 容量有限，飲那瓢最能代表弱水的瞄勾。 Then which糊昙？ 對(duì)待數(shù)據(jù)的正確態(tài)度-----處理之前辛掠，要先了解它(RN...