目的：把兩組bed files 分別pool成一個(gè)bed file，而且疊加到序列區(qū)間要merge起來(lái)陡厘。合并：cat *.bed > outpu...
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如何合并兩個(gè)或多個(gè)bed files
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GWAS群體分層 (Population stratification)：利用plink對(duì)基因型進(jìn)行PCA
來(lái)源：https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/10484467.html感謝作者，拷過(guò)來(lái)做個(gè)筆記。 一惦蚊、為什么...
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phesant（PHEnome Scan Analysis Tool）想著好久沒(méi)更新了呼猪，但我的粉絲們還是會(huì)經(jīng)常來(lái)看看我卤档，所以逃贝，決定把最近學(xué)的東西掛出來(lái)谣辞。 搜了下中文網(wǎng)，幾乎沒(méi)有對(duì)這個(gè)方法進(jìn)行介紹的沐扳，一個(gè)可能是新出的...
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軟件應(yīng)用：PHESANT：用于自動(dòng)化表型組掃描UK生物庫(kù)的工具書(shū)到用時(shí)方恨少潦闲，今天來(lái)學(xué)習(xí)一下英國(guó)生物數(shù)據(jù)庫(kù)中用于表型關(guān)聯(lián)分析的工具，以下主要內(nèi)容是對(duì)截圖所示文章的翻譯迫皱。 摘要 動(dòng)機(jī)：流病隊(duì)列常常包含不同類型...
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GWAS - PRS多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分計(jì)算學(xué)習(xí)筆記一、安裝PRSice（mac版） 經(jīng)試驗(yàn)我覺(jué)得直接從git hub中下載對(duì)應(yīng)的安裝包是最快的：https://github.com/choish...
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PheWAS(全表型組關(guān)聯(lián)分析)----PheWAS的R包測(cè)試及分析(二)
由于上次寫(xiě)完教程一后還有許多疑問(wèn)還沒(méi)解決，在師兄的建議下看了一下R包中核心函數(shù)的源碼(到底在做什么回歸?)卓起，大概解開(kāi)了心中的部分疑惑和敬。最近在看很...
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