以下內(nèi)容參考了博客https://www.cnblogs.com/bio-mary/p/12818888.html、前研究組師妹的總結(jié)資料和MC...
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mcmctree進(jìn)行分化時(shí)間的估算 -
SyRI鑒定SVSynteny and Rearrangement Identifier (Syri), 鑒定基因組間SV完慧。以全基因組比對(duì)結(jié)果作為輸入，可識(shí)別不...
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【如何拆分多倍體亞基因組论巍？】SubPhaser軟件SubPhaser原文鏈接：https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.18173[...
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【報(bào)告筆記】基因組組裝的最后挑戰(zhàn)-T2T
長(zhǎng)讀長(zhǎng)組裝發(fā)展 2012：三代組裝阔挠、二代校正医舆；耗資源竭翠，適合小基因組振坚，如細(xì)菌，4-15%錯(cuò)誤率 2013：三代組裝斋扰、三代校正渡八；仍然只適用小的 20...
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HiFi全基因組測(cè)序技術(shù)HIFI技術(shù)的簡(jiǎn)介 HiFi reads（High fidelity reads） 是Sequel II 三代測(cè)序平臺(tái)推出的兼顧長(zhǎng)讀長(zhǎng)和高準(zhǔn)確度...
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用hifiasm組裝基因組
hifiasm大概是目前為止支持PacBio HiFi數(shù)據(jù)組裝的所有軟件中表現(xiàn)最優(yōu)異的軟件了啃洋。它不但能輸出primary assembly re...
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SVfinder找染色體結(jié)構(gòu)變異染色體結(jié)構(gòu)變異(sv)包括缺失、重復(fù)屎鳍、倒位宏娄、易位、插入等逮壁。 SVfinder主要是基于Python開發(fā)的绝编，能對(duì)全基因組測(cè)序分析出SV結(jié)果。 SV...
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基因家族的收縮與擴(kuò)張基因家族指來自諸多物種的MRCA（Most Recent Common Ancestor貌踏，最近共同祖先）的同一個(gè)始祖基因演化而來的一組基因。 研...
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MCScanX共線性分析共線性 共線性片段是指一個(gè)同一個(gè)物種內(nèi)部或者兩個(gè)物種之間窟勃，由基因組復(fù)制祖乳、染色體復(fù)制、大片段復(fù)制以及物種分化而產(chǎn)生的大片段同源現(xiàn)象秉氧。同源片段內(nèi)部基...
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jcvi(MCscan Python 版) 共線性分析jcvi網(wǎng)址：MCscan (Python version) · tanghaibao/jcvi Wiki · GitHub[https://g...
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