R語(yǔ)言在生物信息學(xué)的應(yīng)用 - 專(zhuān)題

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一鍵完成單因素方差分析及可視化的R腳本
腳本有五個(gè)參數(shù) -f:輸出的數(shù)據(jù)，第一列是樣本名粱侣，第二列是自變量也就是分組信息饭玲，第三列至以后就是因變量侥祭，就是分組效應(yīng) -d:因變量的列名 -i:...

0.3 邱俊輝 0 4
堆疊柱狀圖各成分連線畫(huà)圖的R腳本
18年1月29日宏基因組轉(zhuǎn)載了中科院生態(tài)中心鄧曄組的文章《土壤細(xì)菌定量方法結(jié)合相對(duì)豐度分析揭示種群的真實(shí)變化》[http://mp.weixin...

1.5 邱俊輝 0 22

生信人的20個(gè)R語(yǔ)言習(xí)題及其答案-土豆學(xué)習(xí)筆記
生信人的20個(gè)R語(yǔ)言習(xí)題 http://www.bio-info-trainee.com/3409.html生信人的20個(gè)R語(yǔ)言習(xí)題答案 ...

11.7 土豆學(xué)生信 8 89
實(shí)例講述bioMart包的用法
bioMart包是一個(gè)連接bioMart數(shù)據(jù)庫(kù)的R語(yǔ)言接口，能通過(guò)這個(gè)軟件包自由連接到bioMart數(shù)據(jù)庫(kù)這個(gè)·包可以做以下幾個(gè)工作1.查找某個(gè)...

1.9 邱俊輝 3 25
Bioconductor分析芯片數(shù)據(jù)并提取差異表達(dá)基因
分析基因芯片的數(shù)據(jù)茄厘，提取出差異表達(dá)的基因這次試驗(yàn)的數(shù)據(jù)來(lái)源于文獻(xiàn)：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/...

2.1 邱俊輝 2 16
第二次RNA-seq實(shí)戰(zhàn)總結(jié)(3)-用DESeq2進(jìn)行基因表達(dá)差異分析
DESeq2是一個(gè)用于分析基因表達(dá)差異的R包矮冬，具體操作要在R語(yǔ)言中運(yùn)行1.R語(yǔ)言安裝DESeq2 2.載入基因表達(dá)量文件，添加列名 3.數(shù)據(jù)整合...

1.2 邱俊輝 4 24