TCGA - 專題 - 簡(jiǎn)書

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TCGA

收錄了5篇文章 · 19人關(guān)注

利用GEO2R篩選差異基因及維恩圖快速入門
此教程無(wú)需R語(yǔ)言 Step 1 確定需要檢索的芯片例如 GSE33006 Step 2 利用GEO2R分析差異基因 GEO2R https:/...

0.1 Fobbite0579 0 5
#TCGA系列#TCGA樣本中的注釋文件處理
前面幾期已經(jīng)完成了從TCGA表達(dá)譜/臨床數(shù)據(jù)下載處理整合,本次對(duì)樣本中的有annotations.txt的進(jìn)行分析處理在之前下載的表達(dá)文件中,...

0.1 生信雜談 0 8

#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達(dá)譜數(shù)據(jù)整合
上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表達(dá)譜及臨床數(shù)據(jù)下載?)介紹了使用TCGA 的API下載腫瘤表達(dá)譜及臨床數(shù)據(jù),本期來(lái)處理上期下載的...

0.4 生信雜談 0 8
Ubuntu 18.04 LTS 安裝诱篷、美化
前言 Canonical在４月發(fā)布了全新Ubuntu 18.04 LTS壶唤，新LTS（長(zhǎng)期支持）將是一個(gè)專為個(gè)人、開發(fā)者及企業(yè)用戶所優(yōu)化的版本棕所。在...

1.2 Leihungjyu 0 26
TCGA數(shù)據(jù)下載方法簡(jiǎn)介
TCGA數(shù)據(jù)闸盔，指癌癥測(cè)序數(shù)據(jù)，TCGA的全稱為The Cancer Genome Atlas,癌癥基因組圖譜（TCGA）是美國(guó)國(guó)家癌癥研究所（N...

0.6 Bioconductor 0 10
關(guān)于TCGA（癌癥基因組數(shù)據(jù)集）使用指南
The cancer genome atlas(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)儲(chǔ)存20多種癌癥的基因組數(shù)據(jù)琳省，作為生信喵少不了要下載上面的數(shù)據(jù)來(lái)分析迎吵。寫篇文章介...

1.3 小一_Sherry 0 26 1
用TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)下載到下游分析的學(xué)習(xí)筆記
前言之前一直在用RTCGA包下載數(shù)據(jù)，看著永不更新的數(shù)據(jù)针贬，心里總覺(jué)得怪怪的击费，于是下定決心重新學(xué)習(xí)一個(gè)好用的包——TCGAbiolinks。這個(gè)...

1.8 547可是賊帥的547 47 36 1

TCGA數(shù)據(jù)下載：R包RTCGAToolbox介紹
前面介紹了3種獲取TCGA數(shù)據(jù)的方法：使用TCGA2STAT桦他、TCGAbiolinks蔫巩、RTCGA。這里再介紹一個(gè)包：RTCGAToolbox包...

0.3 Bioconductor 1 17
ROC曲線（受試者工作特征曲線）
ROC曲線在我的記憶中，是在本科三年級(jí)的循證醫(yī)學(xué)課圆仔，預(yù)防醫(yī)學(xué)課上學(xué)過(guò)的垃瞧，現(xiàn)在已經(jīng)很模糊了，但是好像需要用上坪郭，這一次來(lái)回顧下：ROC曲線(rece...

0.6 醫(yī)科研 0 11 1