geo相關(guān) - 專題

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geo相關(guān)

收錄了34篇文章 · 20人關(guān)注

GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記（差異分析、可視化、GSEA）
筆記回顧：1.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記（芯片數(shù)據(jù)下載和數(shù)據(jù)讀取）2.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記（ID轉(zhuǎn)換）3.GEO數(shù)據(jù)庫視頻學習筆記（了解你的表...

21.3 生信start_site 1 68
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-生信技能樹
GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文-第一期-膠質(zhì)母細胞瘤http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mi...

2.0 土豆學生信 1 21

批次效應(yīng)學習
首先是學習優(yōu)秀的帖子最近處理數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)同一個平臺的RNA-seq或者芯片數(shù)據(jù)，不同的樣本之間有時候竟然存在很大的差異蹬蚁，也就是所謂的批次效應(yīng)。因此...

0.8 天涯清水 0 11
解讀GEO數(shù)據(jù)存放規(guī)律及下載，一文就夠-轉(zhuǎn)自生信技能樹
解讀GEO數(shù)據(jù)存放規(guī)律及下載序目，一文就夠原創(chuàng) jimmy 生信技能樹-----解讀GEO數(shù)據(jù)存放規(guī)律及下載，一文就夠 - 做生物信息學分析的朋友...

0.6 天涯清水 0 11
GEO數(shù)據(jù)庫-ID轉(zhuǎn)換系列(一)
GEO數(shù)據(jù)庫-ID轉(zhuǎn)換系列(一) 作者：jzhang 前言：我們都知道很多人在進行GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的時候伯襟，首先遇到的第一個痛點就是探針I(yè)D轉(zhuǎn)換成...

0.7 信你個鬼 1 16
GEO數(shù)據(jù)分析之必備基礎(chǔ)知識
GEO數(shù)據(jù)分析之必備基礎(chǔ)知識本節(jié)主要介紹GEO分析開始之前的準備工作和推薦學習以下非常優(yōu)秀的推文猿涨，學習之后GEO分析就春暖花開了：生信技能樹...

1.3 天涯清水 0 25
缺失值NA并不可怕,只要了解它
缺失值可視化 1.在GEO數(shù)據(jù)挖掘過程中，有時取子集會導(dǎo)致生成的子集都是NA姆怪。那么是因為代碼寫錯了叛赚，或者數(shù)據(jù)類型沒搞清澡绩，還有一種情況就是，數(shù)據(jù)集...

0.8 小夢游仙境 0 11

三種基因表達數(shù)據(jù)的獲得方法(基因表達,微陣列,探針,歸一化)
DNA微陣列基因表達數(shù)據(jù)分析基因表達數(shù)據(jù)反映的是直接或間接測量得到的基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物 mRNA 在細胞中的豐度俺附，這些數(shù)據(jù)可以用于分析哪些基因的表達...

0.4 宇宙獨一無二的我 1 15
GEO數(shù)據(jù)庫分析
保姆式GEO數(shù)據(jù)挖掘演示配對GEO數(shù)據(jù)分析GEO數(shù)據(jù)挖掘系列文TCGAbiolinks做差異分析我的一個paired DEGs 的例子

落寞的橙子 0 1
GEO再學習-GSE42872
GEO再學習 GEO數(shù)據(jù)挖掘已經(jīng)成為生信學者必備技能,我以為自己會跑代碼了就是會了,其實呢,細細去領(lǐng)會每個細節(jié),還是會發(fā)現(xiàn)很多盲區(qū).聽了曉娟老師...

2.6 小夢游仙境 1 42 1