SingleR包簡(jiǎn)介 SingleR是一個(gè)用于對(duì)單細(xì)胞RNA-seq測(cè)序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞類型自動(dòng)注釋的R包(Aran et a...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1852325/RplotUMAP.png?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
SingleR包簡(jiǎn)介 SingleR是一個(gè)用于對(duì)單細(xì)胞RNA-seq測(cè)序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)進(jìn)行細(xì)胞類型自動(dòng)注釋的R包(Aran et a...
Using SingleR to annotate single-cell RNA-seq data 參考:https://www.biocon...
本次教程中柴底,我們將學(xué)習(xí)如何使用Seurat3處理空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。整體的分析流程類似于Seurat的單細(xì)胞RNA-seq分析流程粱胜,同時(shí)我們還引入了...
本文是參考學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組高級(jí)分析六:TCGA生存分析[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyMzMwNDQ...
Compiled: June 24, 2019 This tutorial walks through an alignment of two ...
Aaron Lun*, Jared M. Andrews1, Friederike Dündar2 and Daniel Bunis3 1Was...
標(biāo)準(zhǔn)工作流程 在這個(gè)例子工作流中柄驻,我們演示了我們最近在論文中引入的兩種新方法,Comprehensive Integration of Sing...
本教程介紹了Kang等人(2017)的[https://www.nature.com/articles/nbt.4042]兩組PBMC的對(duì)齊方式...
在此示例工作流程中焙压,我們演示了最近在論文中介紹的兩種新方法鸿脓,即單細(xì)胞數(shù)據(jù)的全面集成: 將多個(gè)不同的scRNA-seq數(shù)據(jù)集組裝成一個(gè)集成參考 將...
單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)技術(shù)的空前的技術(shù)進(jìn)步現(xiàn)在使以低成本和高通量分析單細(xì)胞中全基因組表達(dá)成為可能。 正在進(jìn)行大量工作涯曲,使用scR...