原文： Computational deconvolution of transcriptomics data from mixed cell ...

xCell is a recently published method based on ssGSEA that estimates the ...

Overview xCell is a webtool and a R package that performs cell type enri...

一般的組織樣本或者血液樣本并非單一細(xì)胞構(gòu)成祈惶，其都存在異質(zhì)性扯饶，這種非單一成分樣本的測序?qū)儆赽ulk RNA-seq，測序的結(jié)果表示的也是組織整體上...

首先會給大家介紹腫瘤的微環(huán)境羡藐，腫瘤微環(huán)境是腫瘤細(xì)胞所處的細(xì)胞環(huán)境，其組成包括細(xì)胞外基質(zhì)悯许、可溶性分子和腫瘤基質(zhì)細(xì)胞仆嗦。腫瘤微環(huán)境一旦形成，眾多面會議...

注：本文僅討論轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的免疫浸潤評估先壕。關(guān)于免疫浸潤的計算瘩扼，其實(shí)有不少綜述進(jìn)行過總結(jié)谆甜。筆者看到過2篇發(fā)表于2018年的相關(guān)綜述（雖然現(xiàn)在都20...

一腔孤勇，攜我至此集绰；一把年紀(jì)规辱，還是幼稚； Goals: 文獻(xiàn)為《Local mutational diversity drives intrat...

腫瘤微環(huán)境是近年來的研究熱點(diǎn)栽燕。復(fù)雜而動態(tài)的微環(huán)境中罕袋，腫瘤細(xì)胞與浸潤性免疫細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞等相互作用碍岔，這在促進(jìn)或抑制腫瘤生長浴讯、侵襲、轉(zhuǎn)移以及對病人臨...

因?yàn)樵诰W(wǎng)上看了一些視頻蔼啦，然后用數(shù)據(jù)試了一下榆纽，發(fā)現(xiàn)一直在運(yùn)行，打開代碼一看询吴，發(fā)現(xiàn)是我看不懂的掠河，也不知道哪錯了，在網(wǎng)上搜了半天猛计，不是要錢就是故意給你...

整理這幾天看的文獻(xiàn)的重要信息唠摹。 1. 去卷積方法 CIBERSORT CIBERSORT是2015年在Nature Methods發(fā)表的一個方法...