缺失值填充在數(shù)據(jù)分析領域的預處理過程繞不過去的一個坎哑芹，蛋白質(zhì)組學也不例外，簡單記錄下瞳腌，可能有些地方有其特殊之處论颅。 分析缺失值來源：完全隨機缺失（...
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蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)的缺失值填充
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蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)的歸一化/標準化處理1.前言 目的：調(diào)整由于技術(shù)哎垦，如處理、上樣恃疯、預分漏设、儀器等造成的樣本間誤差。這實際上是一種數(shù)據(jù)縮放的方法今妄。一般在一個表達矩陣中郑口，會涉及到多個樣本，...
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靶向蛋白質(zhì)組
靶向蛋白質(zhì)組學針對性地分析復雜樣品中的特定肽段盾鳞，既可以判斷肽段或蛋白在樣品中的有無（前提是信號高于檢測限）犬性，又可以對不同樣品中的肽段或蛋白進行定...
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【6】蛋白質(zhì)組學鑒定定量軟件之MaxQuant1.簡介 2016年，德國馬普所的Cox和蛋白質(zhì)組學領域巨擘Matthias Mann合作開發(fā)了MaxQuant軟件（MQ）腾仅，并發(fā)表在nbt上乒裆，...
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【5】蛋白質(zhì)組學鑒定定量軟件之PD[toc] 1.簡介 PD全稱Proteome Discoverer，是ThermoFisher在2008年推出的商業(yè)Windows軟件推励，沒錯鹤耍，...
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【4】蛋白質(zhì)組學鑒定軟件之MSGFPlus1.簡介 MSGF+也是近年來應用得比較多的蛋白鑒定軟件肉迫。java寫的，2008年初次發(fā)表JPR惰蜜，2014年升級發(fā)表NC昂拂，免費開源，持續(xù)更新維護...
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【3】蛋白質(zhì)組學鑒定軟件之Mascot1.簡介 Mascot是非常經(jīng)典的蛋白鑒定軟件抛猖，被Frost & Sullivan形容為“質(zhì)譜數(shù)據(jù)檢索的黃金標準”格侯，更新維護速度也很快（已發(fā)布到...
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【2】蛋白質(zhì)組學鑒定軟件之Comet1.簡介 官網(wǎng)：http://comet-ms.sourceforge.net/ 1993年開發(fā)，持續(xù)更新财著，免費開源 適用Windows/Lin...
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【1】蛋白質(zhì)組學鑒定軟件之X!Tandem1. 簡介 X!Tandem是GPM：The Global Proteome Machine（主要基于Web的開源用戶界面联四，用于分析和顯示蛋白質(zhì)...
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蛋白組DIA分析：Spectronaut軟件使用指南官方文檔： https://biognosys.com/media.ashx/spectronautmanual.pdf 0. 準備 Spect...
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