R - 專題 - 簡書

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在火山圖上標(biāo)記基因
要玩圖，離不開哈德雷大神的《R數(shù)據(jù)科學(xué)》伴鳖，第1章和21章是專門講圖的鸿市，我寫過對應(yīng)的筆記：http://www.reibang.com/p/4a...

8.5 小潔忘了怎么分身 16 81 2
ggplot2-plotly|讓你的火山圖“活”過來
火山圖（Volcano Plot）常用于展示基因表達(dá)差異的分布锯梁，橫坐標(biāo)常為Fold change（倍數(shù)），越偏離中心差異倍數(shù)越大焰情；縱坐標(biāo)為P v...

2.6 生信補(bǔ)給站 0 26

典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - Limma差異分析陌凳、火山圖、功能富集
典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - 數(shù)據(jù)獲取到標(biāo)準(zhǔn)化介紹了實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)内舟、數(shù)據(jù)獲取合敦、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化和注釋，下面是如何利用L...

1.4 生信寶典 0 23
R - 相關(guān)性分析
相關(guān)性分析用于評估兩個或多個變量之間的關(guān)聯(lián)性验游。 1. 兩個變量的相關(guān)性分析參數(shù)相關(guān)性檢驗(yàn)( parametric correlation ) ...

10.7 吳十三和小可愛的札記 4 86
R 數(shù)據(jù)可視化 02 | 火山圖
一. 示例數(shù)據(jù)準(zhǔn)備下載：鏈接：https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取碼：wbk6 ...

1.6 白墨石 2 22
R數(shù)據(jù)可視化12:曼哈頓圖
曼哈頓圖的名字來源是因?yàn)槠湫稳缏D的天際線：高聳在較低高度的“建筑物”上方的摩天大樓的輪廓充岛。主要用于GWAS結(jié)果的展示，今天讓我們來看看如何繪...

11.7 jlyq617 2 102
硬著頭皮往下走PCA|GSEA
Paper：Tumor Evolution and Drug Response in Patient-Derived Organoid Mode...

1.9 Juan_NF 2 14

學(xué)習(xí)小組Day4 筆記--ggplot2 in R (涼皮兒）
由于之前零零散散的在技能樹和B站看了些R語言相關(guān)的視頻和分享耕蝉，了解到R是一個非常適合分析數(shù)據(jù)并讓數(shù)據(jù)可視化的一個強(qiáng)大的工具崔梗，做為一只科研狗于是毫...

0.5 程涼皮兒 0 5
折騰了許久才復(fù)現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面，做出作者文章中那樣的圖垒在，但是分組很復(fù)雜蒜魄，需要去...

3.5 小夢游仙境 15 46
N種箱線圖的畫法
圖中標(biāo)示了箱線圖中每條線和點(diǎn)表示的含義，其中應(yīng)用到了分位數(shù)的概念線的主要包含五個數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)场躯，將一組數(shù)據(jù)從大到小排列谈为，分別計(jì)算出他的上邊緣（Maxi...

2.5 亮亮就是亮 0 17