生信分析軟件 - 專題

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生信分析軟件

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scVelo 的使用: 從bam和Seurat獲取輸入數(shù)據(jù)到畫圖
1.數(shù)據(jù)準(zhǔn)備用10x數(shù)據(jù)做scVelo，輸入數(shù)據(jù)分2部分: Seurat 分析后的數(shù)據(jù): 聚類、基因、細(xì)胞信息虐块。 velocyto run 輸...

1.3 RedStones 7 8
(Vim) 復(fù)合命令、重復(fù)阱缓、回撤
一鍵雙雕——復(fù)合命令很多Vim的單鍵命令都可以被看成兩個(gè)或多個(gè)其他命令的組合非凌。下面是類似的一些例子，它們有什么共同點(diǎn)呢荆针？當(dāng)我們輸入ko命令時(shí)...

0.1 王詩翔 0 2

ATAC-seq基礎(chǔ)知識（資源整理）
ATAC-seq全名Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughpu...

0.4 皈依yyy 0 18
samtools-faidx用法
faidx： samtools faidxxxx.fa 能夠?qū)asta 序列建立一個(gè)后綴為.fai 的文件該命令對輸入的fasta序列有一定...

1.1 蘇牧傳媒 0 12
R數(shù)據(jù)可視化9:棒棒糖圖 Lollipop Chart
棒棒糖圖敞嗡，“望文生義”，就是長得像棒棒糖的圖航背。聽起來就很可愛是不是喉悴？今天就讓我們一起欣賞一下棒棒糖圖。什么是棒棒糖圖首先讓我們來看幾張棒棒糖...

3.8 jlyq617 0 30
Dapars尋找APA
1.下載ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主頁：https://g...

0.3 蘇牧傳媒 5 7
celaref ||單細(xì)胞細(xì)胞類型定義工具
Sarah Williams (2019). celaref: Single-cell RNAseq cell cluster labellin...

4.5 周運(yùn)來就是我 7 21

單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)筆記-16-用Scater包分析文章數(shù)據(jù)
劉小澤寫于19.8.20-第三單元第九講：使用Scater包筆記目的：根據(jù)生信技能樹的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)...

0.8 劉小澤 2 10
富集分析DAVID玖媚、Metascape箕肃、Enrichr、ClueGO
前言一般我們挑出一堆感興趣的基因想臨時(shí)看看它們的功能今魔，需要做個(gè)富集分析勺像。雖然公司買了最新版的數(shù)據(jù)庫，如KEGG错森，但在集群跑下來嫌麻煩吟宦。這時(shí)網(wǎng)頁...

3.0 生物信息與育種 0 35
生信學(xué)習(xí)基礎(chǔ)_R語言06_Matching reordering匹配與排序
原文地址：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R/lessons/06_matching_reorde...

0.1 酷睿_1991 0 1