首先感謝生信技能樹大神jmzeng1314提供的github包纷纫，由于我這邊訪問github比較困難枕扫，因此我已經(jīng)導(dǎo)入到我的 gitee 托管平臺...

導(dǎo)讀 個人筆記，初次分析芯片數(shù)據(jù)辱魁，純屬練習(xí)烟瞧，不涉及生物學(xué)意義。 一染簇、數(shù)據(jù)獲取 1 GEO官網(wǎng)中輸入GSE編號参滴，檢索 2 獲取分組信息，下載豐度表...

簡介：風(fēng)險因子關(guān)聯(lián)圖常見于cox風(fēng)險比例模型锻弓，常見于下圖這種三圖聯(lián)合的展示形式砾赔，展示的是由cox風(fēng)險模型區(qū)分出的高風(fēng)險和低風(fēng)險人群在人群比例、生...

通常情況下青灼，通過以下幾種指標(biāo)來對模型進(jìn)行評價暴心。1）區(qū)分度：采用指標(biāo)C-index和ROC曲線來評價區(qū)分度，一般文章都是二選一杂拨。 C-index即...

DCA曲線簡介 DCA是一種評估臨床預(yù)測模型专普、診斷試驗和分子標(biāo)記物的簡單方法。傳統(tǒng)的診斷試驗指標(biāo)如：敏感性弹沽，特異性和ROC曲線下面積僅測量預(yù)測模...

獲得平臺探針注釋信息 這個probe矩陣?yán)锞陀性敿?xì)的探針信息啦～其中第15行是gene_symbol檀夹，接下來會用到 獲取表達(dá)譜數(shù)據(jù)和表型矩陣 這...

一個上午搞定了，難搞的表達(dá)矩陣中提取隨機(jī)樣本贷币。 數(shù)據(jù)包簡介： 首先，GSE63885共有100多例病人樣本亏狰，而我選擇的是隨機(jī)的29例（指定）役纹。如...

01—研究背景 多因素cox回歸分析方法是英國統(tǒng)計學(xué)家 D.R.Cox 于 1972 年提出的比例風(fēng)險回歸模型 (proportional ha...

文章來源：生信技能樹原文：GEO數(shù)據(jù)挖掘-第三期-口腔鱗狀細(xì)胞癌（OSCC）文章標(biāo)題 A pplication of weighted gene...