RNA-seq - 專題

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RNA-seq

收錄了9篇文章 · 22人關(guān)注

水稻GO和KEGG分析
首先乞而，一般我們分析水稻的數(shù)據(jù)時候允乐，選用的是MSU和RAPDB這兩個數(shù)據(jù)庫的genome和gtf文件，這里只介紹MSU的ID辖佣，RAPDB的同理。 ...

2.3 熱衷組培的二貨潛 4 29
RNA-seq流程各階段軟件的最優(yōu)選擇
RNA-seq如今已經(jīng)成了最受寵愛的生信分析了，而如今琳瑯滿目的各種生信軟件擺在具有新時代選擇困難癥的同學(xué)們眼前我們又犯難了。我們該選擇哪套流程...

0.5 sober01 0 31

轉(zhuǎn)錄組入門（5）：序列比對
歡迎來GitHub上fork掸掏，一起進步： https://github.com/xuzhougeng 比對軟件很多，首先大家去收集一下搅幅，因為我們...

7.5 xuzhougeng 32 148 3
RNA-seq分析流程
概覽 Tophat回貼基因組 Cufflinks拼接轉(zhuǎn)錄本 Cuffmerge整合轉(zhuǎn)錄本 Cuffdiff計算轉(zhuǎn)錄本表達量使用R繪制熱圖繪制...

0.4 yangmqglobe 0 6
GO富集分析＼KEGG
##Time:2017-10-8 ##Author:Feng Shengyu #--------------------------------...

0.4 風(fēng)中的魚兒 0 9
生信--RNA-Seq數(shù)據(jù)分析
使用的數(shù)據(jù)阅束，雙端測序數(shù)據(jù)clean data 1 &clean data 2 1呼胚、bowtie建庫 bowtie2-build genome.f...

0.5 風(fēng)中的魚兒 1 11
Bioconductor分析RNA-seq數(shù)據(jù)
參考學(xué)習(xí)《R語言與Bioconductor生物信息學(xué)應(yīng)用》第六章前言 Y叔的公眾號biobabble發(fā)過一篇【聽說你想學(xué)R茄唐？】,七月份發(fā)的但昨...

1.7 王詩翔 0 49

基因表達分析（上）- 差異表達分析
基因表達什么是基因表達，如下是來自于維基百科的解釋：研究方法定量PCR 這部分我不太懂蝇更，所以就放幾段百度百科和維基百科的定義沪编。百度百科 ...

9.2 xuzhougeng 15 242 1
多重檢驗的目的和方法
目的：多次檢驗導(dǎo)致的大量假陽性1. 如果是小概率事件（< 5%），我們就拋棄了最初的美好假設(shè)（H0：沒有差異）年扩，認為觀測的和預(yù)期不一樣（接受H...

0.4 sober01 2 6
關(guān)于P-value蚁廓，及顯著與多重檢驗校正
P-value：通俗的說就是--犯錯誤的概率。在任何一個嚴謹?shù)目茖W(xué)測量中厨幻，我們判斷兩個數(shù)值是否有差異相嵌，必須要考慮這個差異可能來源兩個方面：可能...

0.3 sober01 0 10