0.需求解讀 這是富集分析比較常見的一個圖罐氨,左圖右表咱娶。 圖的最外層是GOterm的編號米间,中間灰色背景層表示基因的logFC分布,可以看到每個te...
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成品預覽 一膘侮、環(huán)境需求 R 及 Rstudio 的安裝配置 一步一步安裝及配置R及Rstudio(詳細圖文) RCircos安裝 二屈糊、繪制圈圖 ...
畫圖時經(jīng)常遇到不同組的數(shù)據(jù)大小相差很大,大數(shù)據(jù)就會掩蓋小數(shù)據(jù)的變化規(guī)律琼了,這時候可以對Y軸進行截斷逻锐,從而可以在不同層面(大數(shù)據(jù)和小數(shù)據(jù)層面)全面反...
一、什么是進化樹 系統(tǒng)發(fā)育進化樹 (Phylogenetic tree):** 一般也叫系統(tǒng)進化樹雕薪,進化樹昧诱。它可以利用樹狀分支圖形來表示各物種或...
繪制circos圖一般需要上圖中的三個文件。 一:染色體配置文件 主要是染色體的位置所袁,名稱盏档,顏色的設置。其中第三列你可以改成想在圖上顯示的名字燥爷,...
1.讀取基因表達數(shù)據(jù) 這是我的基因表達量數(shù)據(jù) 1.1提取部分數(shù)據(jù)集 1.2提取基因表達值所在的列蜈亩,組成新的矩陣,并將矩陣轉置 為什么要轉置前翎,參考...
劉小澤寫于2020.2.6最近再一次做起了轉錄組稚配,但這一次需求有點小改變,需要自己定制一下港华,具體原因看本文吧道川。其中要特別表揚花花??同學,幫了個大...
劉小澤寫于19.10.23筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細胞轉錄組課程探索Smartseq2技術及發(fā)育相關的分析課程鏈接在:http://jm.g...
外顯子定量 可視化 DEXSeq包是用來分析RNA-seq實驗數(shù)據(jù)中exon的差異;這里exon的差異指的是由于實驗條件導致的相對不同的exon...
寫在前面 Emmm... 學校網(wǎng)絡或者電力應是出了問題苇经,無法遠程操作學校服務器。于是宦言,好不容易的不碎片化的時間扇单,還是沒能用在工作上。既然如此奠旺,那...