單細胞系列教程目錄索引,持續(xù)更新...[http://www.reibang.com/p/98fc6c80c216] 參考文獻：Single-...
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腫瘤樣本中的正常上皮鑒定-參考Nature Communications -
單細胞測序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程盆昙、高級分析俯邓、文章復(fù)現(xiàn)
時代的洪流奔涌而至检号，單細胞技術(shù)也從舊時王謝堂前燕，飛入尋常百姓家依痊。雪崩的時候避除，沒有一片雪花是無辜的，你我也從素不相識胸嘁，到被一起卷入單細胞天地瓶摆。R...
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04.單細胞亞群注釋
根據(jù)前述教程，我們已經(jīng)完成了Seurat對象的構(gòu)建-質(zhì)控-降維-聚類性宏。最終得到了細胞的分群如下： 那么接下來我們就要對得到的分群進行細胞類型的注...
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02.認識Seurat對象關(guān)于Seurat對象的構(gòu)建請參考：01.單細胞入門-Seurat對象創(chuàng)建[http://www.reibang.com/p/fc2f29db9...
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單細胞數(shù)據(jù)處理小細節(jié)匯總1. Seurat對象查看當(dāng)前的Assay 在進行了SCTransform操作后赏壹，矩陣默認會變成SCT矩陣，如果不加設(shè)置衔沼，后續(xù)的PCA等操作都是...
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單細胞之富集分析-5：一張圖展示多組富集分析結(jié)果單細胞富集分析系列： 單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程[http://www.reibang.com/p/00f069cb239c...
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單細胞亞群差異基因火山圖單細胞繪圖系列： Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.reibang.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)...
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01.單細胞入門-Seurat對象創(chuàng)建單細胞測序下游原始文件主要以三種形式在GEO存儲 針對三種不同的存儲形式分別對應(yīng)不同的seurat對象創(chuàng)建方式 1.以標(biāo)準的barcodes.t...
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01.infercnv-區(qū)分腫瘤樣本中的正常上皮細胞-infercnv運行參考文獻Therapy-Induced Evolution of Human Lung Cancer Revealed by Single-Ce...
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02.infercnv-區(qū)分腫瘤樣本中的正常上皮細胞-infercnv結(jié)果處理
關(guān)于infercnv的輸入文件整理和運行參數(shù)參考01.infercnv-區(qū)分腫瘤樣本中的正常上皮細胞-infercnv運行[https://ww...
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