參考： 從零開始完整學習全基因組測序數據分析：第3節(jié) 數據質控 前言 如上圖顯示忌怎，整個完整的WGS 流程一般有以下步驟：1）獲取測序數據瞧筛。2）原...

這是我根據之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程渐尿，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經驗，稍作...

前言 在前面的一系列WGS文章中，我講述了很多基因數據分析的來龍去脈，雖然許多同學覺得很有幫助楣嘁，但是卻缺了一個重要的環(huán)節(jié)——沒有提供實際可用的數...

這篇文章很長，超過1萬字珍逸，是本系列中最重要的一篇逐虚，因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀谆膳，對于有一定...

在WGS數據的分析過程中叭爱，我們會接觸到許多生物信息學/基因組學領域所特有的數據文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...

前言 基因測序已是時下熱門漱病，目前除了華大基因之外买雾，其他分布于全中國的大型測序平臺（HiSeq X 10）還有約10個，每個每年大概能完成1.8萬...