在做基因差異表達(dá)分析時(shí)爬早，經(jīng)常會(huì)用DESeq2這個(gè)包，但一直沒有深究其分析的統(tǒng)計(jì)流程。因此秧饮，在這里記錄一下DESeq2校正基因表達(dá)的方法 -- 比...
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理論 | DESeq2 normalized counts -- Median of ratios method -
【編程】三分鐘搞懂PCA主成分分析！歡迎關(guān)注我的專欄( つ??ω??)つ【人工智能通識(shí)】 主成分析PCA Principal components analysis，簡(jiǎn)單說就是物體...
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Trimmomatic詳細(xì)使用
軟件介紹 于2014年首次發(fā)表在Bioinformatics期刊上，Trimmomatic是一個(gè)快速的多線程命令行工具赃阀，可以用來整理和裁剪Il...
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shell十三問
為何叫做 shell ？ shell prompt(PS1) 與 Carriage Return(CR) 的關(guān)系擎颖？ 別人 echo榛斯、你也 ech...
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BAM/SAM文件格式的一些小知識(shí)BAM/SAM文件的一些小知識(shí) 前言 如果不是在陳老師這讀博观游，然后開始折騰BAM/SAM文件，我估計(jì)這輩子都不會(huì)了解到這么多東西吧 SAM/BA...
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hisat2的index差別1.下載三個(gè)index： 2.重命名為： hisat2_grcm38_genome_index/genome [1-sam]hisat2_grc...
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1/2--linux下利用conda安裝所需的軟件肖抱，數(shù)據(jù)庫下載原始數(shù)據(jù)
以下是根據(jù)生信技能樹ChIP-seq視頻記的筆記备典，代碼來自視頻异旧。 1. 安裝軟件 利用以下命令安裝所需的軟件： 軟件安裝在默認(rèn)目錄下 xu...
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實(shí)例講述bioMart包的用法
bioMart包是一個(gè)連接bioMart數(shù)據(jù)庫的R語言接口意述，能通過這個(gè)軟件包自由連接到bioMart數(shù)據(jù)庫這個(gè)·包可以做以下幾個(gè)工作1.查找某個(gè)...
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BED 文件格式
BED (Browser Extensible Data)格式文件就是通過規(guī)定行的內(nèi)容來展示注釋信息 BED文件每行至少包括chrom，chro...
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基因組注釋文件格式 --（一）BED文件格式
轉(zhuǎn)載：https://biozx.top/bed.html[https://biozx.top/bed.html] 參考 UCSC數(shù)據(jù)文件格式[...
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