歡迎關(guān)注:oddxix 有問題,歡迎后臺(tái)溝通 概念 廣義:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)是特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄本的總和。同一細(xì)胞在...

歡迎關(guān)注:oddxix 有問題,歡迎后臺(tái)溝通 概念 廣義:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)是特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄本的總和。同一細(xì)胞在...
通過前期的基因定量屿岂,我們通過RSEM或者Kallisto這些工具得到了每個(gè)基因或者轉(zhuǎn)錄本的表達(dá)量矩陣。輸出的矩陣包含了基因以及在各個(gè)樣本中的表達(dá)...
1. 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)推斷的難題 在RNA-seq中進(jìn)行兩組間的差異分析是最正常不過的了赚楚。 我們?cè)谄渌鼘?shí)驗(yàn)中同樣會(huì)遇到類似的分析淌友,通常煌恢,我們可以用...
原文來自這里瑰抵,略編輯 摘要 簡單且高效地分析RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的能力是Bioconductor的核心優(yōu)勢(shì)。 RNA-seq分析通常從基因水平的序列計(jì)...
RNA-seq的數(shù)據(jù)分析是比較簡單基礎(chǔ)的分析器联,大概流程就是處理下機(jī)的fastq數(shù)據(jù)(trimmomatic)二汛,比對(duì)到人類基因組(hisat2)然...
劉小澤寫于18.10.26今晚10.15開始寫主籍,先寫這么多吧习贫,明天繼續(xù) 第一部分 背景介紹 選用GEO數(shù)據(jù):GSE63310 從雌性小鼠乳腺中提...
劉小澤寫于18.11.12 半年之前我和花花成立了“生信星球”逛球,轉(zhuǎn)眼過得好快千元,我們每天都能和愛生信的小伙伴們交流,還辦了9期培訓(xùn)颤绕,灰常開心終于可...
寫在前面: 1某些富集代碼[http://www.reibang.com/p/5d82acad6008] |關(guān)于GSEA[https:/...
網(wǎng)站:https://sourceforge.net/projects/apatrap/ 說明書:https://sourceforge.net...
最重要的參考鏈接 https://pmbio.org/course/#module-06-rnaseq github鏈接:https://git...