MEGAN(Metagenome Analyzer)是宏基因組學(xué)進行物種和功能研究的常用軟件,實際上現(xiàn)在的Diamond+MEGAN6已經(jīng)是一套...
![240](https://upload.jianshu.io/collections/images/1847367/%E5%AE%8F%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
MEGAN(Metagenome Analyzer)是宏基因組學(xué)進行物種和功能研究的常用軟件,實際上現(xiàn)在的Diamond+MEGAN6已經(jīng)是一套...
宏基因組學(xué) 宏基因組學(xué)[https://baike.baidu.com/item/%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%...
昨天下午搗鼓了一下宏基因組物種注釋過程(基于nr庫),現(xiàn)在將整個流程記錄一下驹止。軟件需求:blast浩聋,diamond,taxonkit(安裝自行百...
導(dǎo)讀 使用 HUMAnN2(The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2)進行宏基因組學(xué)分析臊恋。 HU...
Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測衣洁、ORF開放閱讀框識別(Open Reading fr ame)和蛋白翻譯之后,就可以進行功能注...
1. 簡介 Kraken2是一個基于k-mer算法的高精度宏基因組序列分類軟件抖仅,能夠快速的將測序reads進行物種分類闸与。 Kraken2官網(wǎng)[h...
導(dǎo)讀 HUMAnN(全稱HMP Unified Metabolic Analysis Network)最早由Curtis Huttenhower...
導(dǎo)讀 上一篇介紹了MetaPhlAn:宏基因組微生物分類分析教程[http://www.reibang.com/p/015cbdb80ce1]...
導(dǎo)讀 1 MetaPhlAn獲得宏基因組物種和物種豐度2 MetaPhlAn結(jié)果合并和可視化3 GraPhlAn繪制進化樹4 LEfSe尋找分類...
宏基因組學(xué)(metagenomics)是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體所有基因組作為研究對象,利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生...