Biostar Handbook學(xué)習(xí)小組 - 專題

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Biostar_handbook||charpter 15_16 腳本進階_數(shù)據(jù)可視化
Charpter 15 Advanced Command Line 背景在Linux下的數(shù)據(jù)分析從質(zhì)控到比對到后續(xù)分析等斗躏，每一步都需要獨立的軟...

0.1 Dawn_WangTP 0 1
Biostar_handbook||charpter 14. SAM格式及SAMTOOLS操作
Charpter_14 Sequence Alignment Maps(SAM) SAM文件是由Tab(\t)分割攻谁，面向‘行’的文本格式文件合住，主...

0.2 Dawn_WangTP 0 6

Biostar_handbook||charpter 13. 短序列比對BWA/Bowtie
Charpter_13 Short Read Aligners 背景定義：Short read Aligners are commonly u...

0.2 Dawn_WangTP 4 6
Biostar_handbook || Charpter 5. 本體論(Ontologies)
Ontology 概念：個人理解就是生物信息學(xué)界對生物上的一些重要信息意荤，如序列和基因信息制定一個通用的標準化協(xié)議泞辐，對一些概念陪拘、信息進行精準的...

0.2 Dawn_WangTP 0 4
Biostar_handbook||Charpter_6789_數(shù)據(jù)的格式_獲取_質(zhì)控_seqkit
Charpter6：數(shù)據(jù)的格式Data Formats 常用數(shù)據(jù)庫 NCBI EBI Uniprot Phytozome Ensemble pl...

0.1 Dawn_WangTP 9 5
Biostar_handbook||charpter 12. BLAST
BLAST: basic local alignment search tool菜枷。包括：blastn, blastp, blastx, tbla...

0.1 Dawn_WangTP 0 2
Biostar_handbook||charpter 10_11. 模式匹配_序列聯(lián)配
Charpter 10 Sequence Pattern 模式匹配 Sequence Pattern序列模式：A sequence patter...

0.1 Dawn_WangTP 0 1

純二代測序從頭組裝基因組
基因組組裝基因組組裝一般分為三個層次，contig, scaffold和chromosomes. contig表示從大規(guī)模測序得到的短讀(re...

5.8 xuzhougeng 3 122
2018-03-01
What is BLAST:BLAST is a methodology to search few and short sequences a...

大寶貝喜歡徐先生 0 0
biostar handbook(十)|如何進行變異檢測
什么是基因組變異基因組變異是一個定義比較模糊的概念. 所謂的變異是相對于一個完美的“參考基因組”而言涮较。但是其實完美的“參考基因組”并不存在稠鼻，因...

1.0 xuzhougeng 0 22