生物信息學(xué) - 專題

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用annovar對vcf（SNP&INDEL）文件進(jìn)行注釋
將原始fq文件通過FastQC-align-samtools||GATK等流程最終得到vcf文件深滚，也就是記錄某些位點(diǎn)變異的文本文件寄疏。但只是通過看...

0.7 sober01 3 19
RNA-seq完整分析過程
linux基本命令第六章 Linux文件與目錄管理極客學(xué)院服務(wù)器高通量相關(guān)基礎(chǔ)知識生信一百講 1伴榔、 Anaconda Anaconda是...

12.9 熱衷組培的二貨潛 28 210

BSR-(RNA-seq)數(shù)據(jù)進(jìn)行BSR分析
使用工具GATK4斯稳。GATK基礎(chǔ)RNA-seq分析完整版BSR參考GATK官方RNA-seq calling流程最新版的BSR分析流程流程參考W...

0.8 wo_monic 12 12
VCF格式
劉小澤寫于18.7.17所有的數(shù)據(jù)海铆，一旦要找變異位點(diǎn)信息，就離不開VCF挣惰。豆豆也是在寫一個重測序的操作流程卧斟，遇到了VCF文本，之前也是沒有了解過...

4.4 劉小澤 2 73
一些perl的小技巧
劉小澤寫于18.12.2這個周末做了不少事憎茂，參加了P4 China精準(zhǔn)醫(yī)療會議珍语，第一次參加這種國際性會議，長了不少見識竖幔，同時帶回來很厚一摞“背景...

0.3 劉小澤 0 6
學(xué)習(xí)一點(diǎn)perl單行命令知識
劉小澤寫于2020.3.13推薦一本書：《Perl One-liners：130 Programs That Get Things Done》P...

0.2 劉小澤 0 4 2
Linux命令行文本操作一文就夠
原創(chuàng)：熊+jimmy+SX 生信技能樹主要是awk/grep/sed這三駕馬車板乙，加上vi這個神器，最后輔助一些小工具拳氢，包括 wc,cat,di...

0.4 超級無敵大蝸牛 0 6

ggplot2高效實(shí)用指南
簡介文章較長募逞，點(diǎn)擊直達(dá)我的博客，瀏覽效果更好馋评。本文內(nèi)容基本是來源于STHDA放接，這是一份十分詳細(xì)的ggplot2使用指南，因此我將其翻譯成中文留特，...

6.1 taoyan 7 159 1
生信blogs匯集
MOOC網(wǎng)站 1.學(xué)堂在線--清華大學(xué)2.華文MOOC--北京大學(xué)3.中國大學(xué)MOOC 優(yōu)秀博客/網(wǎng)站 1.liuhui劉輝2.生信寶典文章集錦...

0.8 caokai001 0 5
Linux ${} 變量內(nèi)容的提取和替換功能
1纠脾、對變量取值 2、求字符串的長度 3蜕青、提取位置3到最后的字符 4苟蹈、從位置3，開始提取5個字符 5右核、從左邊開始慧脱，刪除最短匹配r 6、從左邊開始蒙兰，...

2.8 caokai001 0 14