之前寫過用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作圖,但是圖沒有最新版enrichplot包的gse...
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GSEA的介紹:https://www.omicsclass.com/article/230GSEA有相應的軟件,其實clusterProfil...
三月week1文獻閱讀: Pathway enrichment analysis and visualzation of omics data ...
07.箱線圖繪制 清除當前環(huán)境中的變量 設置工作目錄 基礎(chǔ)boxplot函數(shù)繪制箱線圖 ggplot2包繪制箱線圖 ggpubr包繪制箱線圖
上篇文章中提了一下如何通過ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標記,本文將詳細介紹骤坐。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進行演...
WGCNA分析基于兩個假設:1.相似表達模式的基因可能存在共調(diào)控、功能相關(guān)或處于同一通路棒旗,2.基因網(wǎng)絡符合無尺度分布熟菲∈缚眨基于這兩點库北,可以將基因網(wǎng)絡...
終于超過1k粉絲啦~之前說要小小慶祝一下爬舰,害怕直接放文章里會被封文章,所以福利大家可以見評論寒瓦。前幾周忙著答辯畢業(yè)事宜沒有時間更新情屹,雖然這幾天也挺...
參考這篇:??????我覺得學RNA-seq必看的文獻!孵构!??????這篇寫的特別好:RNAseq-workflow本科生搞定RNA-seq上游數(shù)據(jù)分析RN...
日更已經(jīng)是不可能的了屁商,讓我向周更靠齊烟很。本節(jié)我們來講箱形圖(Box-plot)颈墅。 什么是箱形圖 箱形圖(Box-plot)是一種用作顯示一組數(shù)據(jù)分...
biomart是一個R package,能夠完成基因注釋的工作雾袱。在我得到差異表達基因之后恤筛,可以直接使用該包直接注釋。 網(wǎng)絡上許多代碼已經(jīng)過時芹橡,特...