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使用FuSeq_WES處理WES數(shù)據(jù)尋找fusion-gene
數(shù)據(jù)比對 使用FuSeq_WES
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Single Cell RNA-seq Analysis 學(xué)習(xí)記錄（二）：數(shù)據(jù)整理處理原始scRNA-seq數(shù)據(jù) 2.1 FastQC 當(dāng)你獲取到單細(xì)胞下機(jī)數(shù)據(jù)的時候看锉，第一步需要做的就是檢查數(shù)據(jù)質(zhì)量。本次教程使用的數(shù)據(jù)為(Ko...
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提取heatmap作圖中的cluster行名或者列名
此post旨在提取heatmap作圖中的cluster行名或者列名 其實具滴，對heatmap熱圖提取cluster就是對hclust的結(jié)果提取cl...
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Genome Biology文章解讀：組蛋白調(diào)節(jié)因子(HMRs)只負(fù)責(zé)組蛋白修飾相關(guān)功能？如何揭示HMRs的非經(jīng)典功能
ncHMR detector: a computational framework to systematically reveal non- ...
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gfold問題處理記錄
這次在新的服務(wù)器上安裝gfold的時候，偶然發(fā)現(xiàn)GFOLD的官網(wǎng)已經(jīng)404了毙籽，于是索性就conda一套進(jìn)行安裝conda install -c ...
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R語言升級到3.6.0后遇到的Bioconductor安裝問題
前言 目前R 3.6.1 都已經(jīng)preRelease了，我筆記本上的電腦也趕忙把R從3.5.4升級到3.6.0（當(dāng)然生產(chǎn)力相關(guān)環(huán)境還沒敢亂升級毡庆，...
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處理conda安裝工具的動態(tài)庫問題——解決記錄問題記錄 在conda的某工作環(huán)境下使用rmats2rmats2sashimiplot作圖的時候坑赡，發(fā)現(xiàn)有一個報錯：無法找到libcrypto.s...
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R語言S3對象的簡單學(xué)習(xí)前言 最近在琢磨單細(xì)胞的分析包Seurat，其對象type是一個S4 object扭仁，value顯示為S4 object of class Seu...
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R語言里面的apply()家族簡述這個教程目的在于介紹apply()家族在R語言的用法垮衷，apply()函數(shù)算是R語言里面很基礎(chǔ)的一個函數(shù)，同時還有sapply()乖坠、lapply(...
