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NCBI官方真核生物全基因組注釋流程首次開源！嘗鮮體驗(yàn)踩坑貼奉上~萌哥碎碎念：NCBI的官方注釋流程一直都是出了名的效果拔群準(zhǔn)確度極高菲盾，但可惜一直都是非開源的，看到這么好用的工具卻用不到自己的項(xiàng)目里各淀，心里可太刺...
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datasets使用實(shí)例 | 如何批量獲得特定物種的taxonomy信息懒鉴？
工具 使用到的工具是： datasets jq datasets是NCBI官方的工具，可以直接調(diào)用NCBI的API進(jìn)行信息的查詢碎浇，返回的結(jié)果是j...
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機(jī)器學(xué)習(xí)/深度學(xué)習(xí)與基因組學(xué)資源搜羅
作為一個(gè)genomics方向的研究者临谱，在AI的浪潮中總是避免不了焦慮。擔(dān)心被時(shí)代拋棄奴璃。 在以前悉默，不識(shí)字的我們稱之為文盲；再后來苟穆，英語不好是地球村...
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萌哥修BUG | Ubuntu 22.04.3 LTS如何給根目錄擴(kuò)展空間
省流版 前提條件： 有root權(quán)限 不涉及分區(qū)的刪除增加重新分區(qū) 不需要重啟或者關(guān)機(jī) 不需要到服務(wù)器面前才能操作抄课，遠(yuǎn)程也可以完成 step 1：...
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新手的R包安裝指南：一條命令就可以把任何來源的R包安裝上啦
太長不看版 只需要使用BiocManager::install()就可以把CRAN唱星、bioconductor、GitHub來源的包都安裝上了跟磨。 ...
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【讀者投稿】用Bypy直接下載百度云盤文件到服務(wù)器
背景介紹 組學(xué)數(shù)據(jù)越來越大魏颓，數(shù)據(jù)傳輸已經(jīng)成了一個(gè)組學(xué)合作研究中的重要限制因素。百度云盤是數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和傳輸?shù)闹匾ぞ咧ㄉ梗琤ypy是一個(gè)為了解決數(shù)據(jù)操作...
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【文獻(xiàn)速讀】Sequence basis of transcription initiation in human genome
要讀的文章太多了甸饱。實(shí)在是沒時(shí)間把所有的感興趣的文章都精讀一遍。那就借助GPT快速總結(jié)一下文章的內(nèi)容仑濒。 文章標(biāo)題：Sequence basis o...
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用agat把embl格式轉(zhuǎn)換成gff格式
我最近在用YGAP (Yeast Genome Annotation Pipeline) 做yeast基因組的注釋叹话。 YGAP生成的注釋結(jié)果默認(rèn)...
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在Linux下用ftp和lftp從FTP站點(diǎn)下載文件
背景介紹 最近我需要通過FTP站點(diǎn)下載合作者提供的測序數(shù)據(jù)，因此研究了一下怎么快速地從FTP站點(diǎn)下載文件墩瞳。 測試的工具主要是ftp和lftp 什...