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RNA-seq的counts值怨规，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同
RNA-seq的counts值絮吵，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的異同 現(xiàn)在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, ...
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R語(yǔ)言如何用正則表達(dá)式提取特定的字符串
R語(yǔ)言如何用正則表達(dá)式提取特定的字符串 原創(chuàng) 徐洲更 這個(gè)帖子是為了果子的一個(gè)提問(wèn) R語(yǔ)言能不能實(shí)現(xiàn)匹配括號(hào)里面的內(nèi)容, 但是不包括括號(hào) 這個(gè)問(wèn)...
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GPL16686芯片平臺(tái)分析
＃芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix Human Transcriptome Array 2.0芯片,由于目前還沒(méi)有現(xiàn)成的R包可以用弧烤，因此...
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轉(zhuǎn)錄組表達(dá)定量- Read count？CPM? RPKM? FPKM?
轉(zhuǎn)錄組表達(dá)定量- Read count蹬敲？CPM? RPKM? FPKM? 1.Read count 數(shù)值概念：比對(duì)到某基因的reads數(shù)暇昂。 用途...
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GPL17586、GPL19251和GPL16686平臺(tái)芯片ID轉(zhuǎn)換
原文載于生信技能樹(shù)我寫(xiě)此文是為了致敬生信技能樹(shù)團(tuán)隊(duì)伴嗡！感謝他們無(wú)私分享急波！ 以下是生信技能樹(shù)學(xué)員筆記投稿 芯片分析中經(jīng)常會(huì)遇到Affymetrix ...
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芯片的表達(dá)數(shù)據(jù)為負(fù)值？
芯片的表達(dá)數(shù)據(jù)為負(fù)值瘪校？ 隔離期間分析數(shù)據(jù)時(shí)發(fā)現(xiàn)有些芯片的數(shù)據(jù)的表達(dá)量歸一化（未取對(duì)數(shù)）后還是負(fù)值澄暮；當(dāng)時(shí)認(rèn)為是芯片類(lèi)型的問(wèn)題，今天發(fā)現(xiàn)有人也遇到了...
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GSEA的分析匯總-轉(zhuǎn)載
GSEA的分析匯總 學(xué)習(xí)GSEA 生信技能樹(shù) GSEA的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理試講 GSEA GSEA這個(gè)java軟件使用非常方便阱扬，只需要根據(jù)要求做好GCT...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候可以加上wgcna-轉(zhuǎn)自生信技能樹(shù)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時(shí)候可以加上wgcna 生信技能樹(shù) WGCNA分析大家都不陌生了泣懊，我在生信技能樹(shù)多次寫(xiě)教程分享WGCNA的實(shí)戰(zhàn)細(xì)節(jié)： 一文...
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再也不用擔(dān)心Excel基因名變成日期了
前一段時(shí)間處理數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)Excel里面的差異基因有一部分變成日期了，直接想到了之前在生信技能樹(shù)看到博文÷榛蹋現(xiàn)在轉(zhuǎn)發(fā)出來(lái)馍刮。 聽(tīng)說(shuō)Excel表格動(dòng)了你的...
