高通量數(shù)據(jù)處理學習筆記 - 文集

8篇文章 · 0字 · 12人關(guān)注

高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（七）：使用ChIPQC包檢查ChIP-seq的質(zhì)量
參考文章六六這篇文章的作者看來是詳細的觀看了ChIPQC manual并且參考了已有文檔進行了學習和實踐儒将。Manual見Manual。討論 ...

0.5 5102 2 6
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（六）：什么是測序深度和測序覆蓋度碗暗？
前言 Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses...

1.7 21125 2 27

高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（零）：NGS分析如何選擇合適的參考基因組和注釋文件
前言現(xiàn)有比對工具在做mapping之前，都需要下載對應(yīng)物種的參考基因組做index，而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情著觉。現(xiàn)有的參...

2.1 13729 0 36
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（五）：上傳二代測序數(shù)據(jù)到GEO
前言實驗室最近有一批數(shù)據(jù)在發(fā)表文章之前需要上傳到GEO Gene Expression Omnibus。所以記錄下上傳數(shù)據(jù)的流程給大家借鑒惊暴。 ...

0.5 13262 0 10
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（四）：DeepTools學習筆記
前言開題啦饼丘，所以需要整合自己之前處理過的數(shù)據(jù)包括可視化作圖，在GALAXY上翻到DeepTools正好有著一點用處辽话，適當?shù)母懔艘徊ㄊ虑橐薷耄槑в?..

3.1 25478 1 28
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（三）：Pathway Analysis及GSEA
Pathway Analysis討論及基因富集分析軟件（Gene Set Enrichment Analysis，GSEA）使用實戰(zhàn) 在所有物是...

1.9 18660 6 33
高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（一）：比對軟件STAR的使用
high-throughput seq analysis急先鋒——STAR的使用介紹在所有物是人非的景色里油啤，我最中意你典徘。正體這次給大家?guī)?..

1.3 25603 4 28

高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（二）：Read Counts的提取
high-throughput seq analysis急先鋒——HTSeq的使用介紹在所有物是人非的景色里，我最中意你益咬。正體 HTSeq作...

0.2 19721 0 8