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cellranger使用的初步探索（4）：R讀取cellranger的輸出文件在上一篇筆記里，練習(xí)了使用cellranger aggr整合不同GEM well的樣品（cellranger使用的初步探索（3）cellrang...
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cellranger使用的初步探索（3）cellranger aggr在學(xué)習(xí)cellranger aggr這一步之前，還是需要再一次復(fù)習(xí)10x Genomics的測(cè)序原理卖词。在cellranger aggr部分瓷耙，官網(wǎng)...
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cellranger使用的初步探索（2）理解cellranger count輸出文件在上一篇筆記的結(jié)尾處扶歪，提到了cellranger count這一步走哺，之前幾天我一直是用的服務(wù)器里128G和200G的內(nèi)存試著運(yùn)行這一步壳炎，并且限制...
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cellranger使用的初步探索（1）本篇筆記是按照單細(xì)胞天地公眾號(hào)教程里的代碼練習(xí)的，因?yàn)橹傲私獾絚ell ranger運(yùn)行需要大量的內(nèi)存雨女，無奈自己的電腦配置不行，現(xiàn)在有了服務(wù)器...
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RNA velocity分析練習(xí)（四）聚類以及velocity可視化系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝3.RNA veloci...
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RNA velocity分析練習(xí)（三）生成loom文件
系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝 Velocyto軟件針...
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RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝
系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理 要獲取我們需要的loom文件阳准，你需要先安裝以下文件： 首先要求你的pyt...
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RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理目前有多種方法可以進(jìn)行RNA velocity的分析： scVelo（參考文章：?jiǎn)渭?xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析|| scVelo 教程：RNA速率分析工具...
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RNA velocity of single cells文獻(xiàn)學(xué)習(xí)在之前的一個(gè)視頻學(xué)習(xí)系列筆記里氛堕，有一篇筆記提到了RNA velocity（Single cell RNA-seq data analysis w...
