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基于全基因組的基因家族分析（4）：R包ggtree構(gòu)建SlNramp家族進(jìn)化樹(shù)繼續(xù)之前還沒(méi)有完成的內(nèi)容。因?yàn)樽罱趯W(xué)習(xí)Y叔的R包--ggtree蚪缀，所以就順便拿這個(gè)內(nèi)容來(lái)進(jìn)行展示，作為一個(gè)例子來(lái)記錄恕出。nwk樹(shù)文件和R代碼文件...
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基于全基因組的基因家族分析（3）：SlNRAMP家族基因CDS和Genomic DNA序列獲取今天繼續(xù)進(jìn)行下一步询枚，也是序列文件的獲取，有了這些數(shù)據(jù)浙巫，我們才可以進(jìn)行下一步的工作金蜀，才能夠繪制一些圖片。 1. CDS序列獲取 SlNRAMP家族...
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基于全基因組的基因家族分析（2）：SlNRAMP家族基因成員鑒定1.找到你所感興趣的基因家族 番茄（Solanum lycopersicum）的畴，最喜愛(ài)的蔬菜水果之一渊抄。摘錄維基百科最基本的介紹，詳細(xì)了解番茄的起...
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HMMER3.1使用最近在探索全基因組基因家族的分析方法丧裁，而找到某一家族需要通過(guò)保守結(jié)構(gòu)域來(lái)預(yù)測(cè)护桦，從而找到物種的某一基因家族，從而進(jìn)行之后的分析煎娇。這里就需要用到HM...
