單細胞 - 文集

本文比較長极景，長到需要一個目錄ORA1.輸入數據之基因2.輸入數據之基因集合2.1 可以是預設的基因集合名稱2.2 可以是來自msigdb網站的g...

350 0 0

1.R包和數據準備隨便一個h5文件即可概作。我這里使用的是pbmc3k厦酬，scanpy推文最后生成的文件就是它官帘。 2.獲取用于評分的基因集合基本上...

256 0 1

0.1 135 0 1

1.數據和包準備著名的pbmc3k數據：https://cf.10xgenomics.com/samples/cell/pbmc3k/pbmc...

497 0 0

1.背景知識眾所周知训唱，單細胞轉錄組數據的輸入文件是多種多樣的，詳見:不同文件格式單細胞數據讀取流程 https://mp.weixin.qq....

128 0 1

這篇文章介紹的是有分組的單細胞數據怎樣分析挚冤，數據來自GEO的GSE231920况增，有3個treat，3個control樣本训挡，代碼完整澳骤，可以自行下載...

0.1 404 0 1

0. 背景知識細胞通訊是單細胞數據高級分析中比較常見的一個歧强，我們習慣使用的R包是CellChat。這個是CellChat的一手教程： htt...

0.6 1318 0 4

0.背景知識做擬時序分析是為了探索自己感興趣的幾種細胞之間的發(fā)育關系为肮，一般不是用全部類型的細胞來做的摊册。例如本例中選擇了CD14和CD16單核細...

1.3 598 0 1

0.背景知識做擬時序分析是為了探索自己感興趣的幾種細胞之間的發(fā)育關系，一般不是用全部類型的細胞來做的颊艳。例如本例中選擇了CD14和CD16單核細...

1.4 450 1 3