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Seurat分析Slide-seq空間轉(zhuǎn)錄組此教程是使用Seurat分析 Slide-seq v2[https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020...
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Seurat分析10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)本教程使用Seurat包進行10x Visium單細胞空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析类浪。 這個教程涉及： 標(biāo)準(zhǔn)化 降維和聚類 檢測空間差異表達基因 交互可視化...
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loompy API
# Creating and connecting ##Creating Loom files 創(chuàng)建一個loom文件载城，需要提供一個矩陣數(shù)據(jù)（nu...
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loomR介紹及使用指南隨著單細胞技術(shù)的發(fā)展，數(shù)據(jù)量增加使得計算需求呈指數(shù)增長费就。分析單細胞數(shù)據(jù)時诉瓦，使用稀100000個細胞的系數(shù)矩陣處理對于Seurat 來說就很有挑戰(zhàn)...
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單細胞測序分析: Seurat V3聯(lián)合harmony進行單細胞數(shù)據(jù)整合分析#R包導(dǎo)入 #數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)下載pbmc_stim 數(shù)據(jù)導(dǎo)入 #初始化Seurat 對象 使用Harmony之前，需要構(gòu)建一個Seurat對象力细， 進...
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單細胞測序分析: R harmony包 整合多個單細胞數(shù)據(jù)Fast, sensitive and accurate integration of single-cell data with Harmon...
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單細胞測序分析: Seurat 使用教程原文見Seurat - Guided Clustering Tutorial, Compiled: April 17, 2020 #1 Seur...
