比如要畫某個marker基因的featureplot 如果我想要分組畫 這時候會發(fā)現(xiàn)圖例不見了添加圖例:
做單細胞轉錄組的數(shù)據(jù)的時候很多時候都找了一個細胞類型之后腻惠,想知道這個細胞類型中case和control組上下調(diào)基因時怎么樣的,做差異嘛,大部分都...
每個顏色是一個細胞類型,左邊柱子是control右邊是case骡湖,縱坐標是細胞占比
1.VlnPlot 2.過濾 矩陣隨機抽樣 求比例 求每個基因在細胞中的比例 top50高表達的基因 挑選顏色 多個圖放一張 多個分辨率之間關系...
umap發(fā)現(xiàn)自己的簇順序有問題 設置一下因子就好 ggplot繪制umap圖 你到底想要什么樣的umap/tsne圖[https://www.j...
好久沒有學習RNAseq的東西了,今天隨意翻到一篇很不錯的總結峻厚,這里了只是我的學習筆記响蕴,原文會更好一些:https://mp.weixin.qq...
RNA-seq數(shù)據(jù)分析 我們對工具和技術的評估落腳點在它們鑒定出的差異基因的準確性。為了完成這個評估惠桃,至少需要四個不同的分析階段(圖2;表2)浦夷。...
學習教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247491455&idx...
https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247490037&idx=1&s...