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批量化RNA-seq
建立索引 拆分sra數(shù)據(jù) 批量壓縮文件 rna-seq流程
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如何查找一個(gè)物種的基因所在的信號(hào)通路前幾天老師給我布置了一個(gè)小任務(wù)严嗜，讓我去查找某個(gè)基因所在的全部信號(hào)通路亚铁。 咔咔咔棚愤，在網(wǎng)上一頓搜索骏庸，發(fā)現(xiàn)并沒有具體的操作指南，只能硬著頭皮自己去摸索...
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統(tǒng)計(jì)測序原始文件基本信息
今天發(fā)現(xiàn)一個(gè)很好用的軟件FastqCount袒啼，可以很快速的統(tǒng)計(jì)測序文件的基本信息下面介紹一下它的用法 下載并激活FastqCount 使用Fas...
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全長轉(zhuǎn)錄組分析
sample1 sample1基本測序信息統(tǒng)計(jì) 畫頻數(shù)分布直方圖 獲取一致性序列CCS 統(tǒng)計(jì)CCS信息 畫頻數(shù)分布直方圖 CCS分類 isose...
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lncRNA分析
處理原始數(shù)據(jù)文件 rawdata質(zhì)控 統(tǒng)計(jì)cleandatabase 建立索引 hisat2比對(duì) 排序 統(tǒng)計(jì)比對(duì)率 stringTie組裝 合并...
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CPC2的下載及使用
先下載軟件壓縮包到桌面哈扮，地址（http://cpc2.gao-lab.org/data/CPC2-beta.tar.gz[http://cpc2...
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全長轉(zhuǎn)錄組-結(jié)果：樣品比對(duì)
全長轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)學(xué)完并分析完了，前面碼代碼和理順?biāo)悸芬膊蝗菀昨驹伲窒硪徊糠肿约旱牧鞒探o感興趣的朋友灶泵。 每個(gè)轉(zhuǎn)錄本有多少個(gè)CDS區(qū)域 提取所有有CDS...
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全長轉(zhuǎn)錄本SSR預(yù)測
SSR-簡單重復(fù)序列預(yù)測（MISA） MISA是使用 perl 編寫的一支程序，能識(shí)別出序列中的微衛(wèi)星和復(fù)合微衛(wèi)星（兩個(gè)微衛(wèi)星之間由由不多于10...
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