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WGCNA全稱(chēng)weighted gene co-expression network analysis妄呕,即加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析牺荠。它是一種分析多...
生存模型的構(gòu)建方法包括:1. Lasso回歸婚被;2. Cox多因素回歸子姜;3. 隨機(jī)森林酝润;4. 支持向量機(jī) 可以把log_rank_test或cox...
1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一種單因素生存分析燎竖,它可用于研究1個(gè)因素對(duì)于生存時(shí)間的影響。參考:生存分析之K...
1. clusterProfiler包要销,bitr()轉(zhuǎn)換ID函數(shù) clusterProfiler 是Y叔寫(xiě)的一個(gè)功能強(qiáng)大的R包构回,可以用來(lái)做各種富...
做差異分析需要的數(shù)據(jù):表達(dá)矩陣和分組信息TCGA的數(shù)據(jù)只要表達(dá)矩陣就夠了疏咐,因?yàn)槠銽CGA的樣本ID比較特殊纤掸,樣本ID的第14和15位是>=10還...
TCGA數(shù)據(jù)下載方法:gdc-client,Xena和gdcRNAtools 需要下載的數(shù)據(jù)組學(xué)信息(樣本):(存儲(chǔ)單個(gè)病人表達(dá)數(shù)據(jù)浑塞,需整理為表...