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本期內容同步發(fā)布于單細胞天地微信公眾號是辕。 回顧——細胞通訊網絡構建 前面的帖子中我們已經成功地進行了細胞間通訊網絡的構建,總的來看借助下面簡易的...
本期內容已同步分享至單細胞天地 細胞通訊是指細胞與細胞之間的聯(lián)系剪返。細胞和人類一樣涩盾,多細胞生物的很多細胞會相互作用州泊,形成“細胞社會”十饥,在這個社會里...
水滴石穿窟勃,非一日之功 本期內容同時發(fā)布于單細胞天地微信公眾號。 在進行單細胞分析時逗堵,非常重要的一步就是聚類分群秉氧,而在這個過程當中經常令人困惑的是...
水有源,故其流不窮蜒秤;木有根汁咏,故其生不窮。 長期以來作媚,我們的單細胞分析僅僅停留在調包攘滩、套函數、……掂骏,這個過程會“蒙住”我們的眼睛轰驳,有些時候我們需要...
前面給大家介紹過神兵利器——單細胞細胞類群基因marker鑒定新方法:COSG[http://www.reibang.com/p/bfcf90...
由于單細胞數據本身就具有數據量大的特點,所以在進行單細胞數據分析時往往會出現(xiàn)運行時間太長的問題弟灼。 不過好在 Seurat 為我們提供了部分函數與...
在單細胞數據分析當中,當我們聚類分群完成之后冒黑,緊接著就是細胞類型注釋田绑,細胞類型的注釋就離不開 基因marker ,即在目標細胞類群和其它細胞類群...
前段時間在生信技能樹單細胞學習小分隊分享單細胞文章復現(xiàn)抡爹,一不小心就踩了一個坑……記錄在這兒和大家一起分享掩驱。 背景 主要是想復現(xiàn)2020年發(fā)表在 ...
在單細胞分析當中,經常會遇到整合分析的問題冬竟,即去除多樣本數據之間的批次效應(batch effect)欧穴,那么什么是批次效應呢?簡而言之泵殴,批次效應...