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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】四细移、差異分析（limma）、繪圖和富集分析參考代碼在這： 1 差異分析 需要的數(shù)據(jù)：表達(dá)矩陣熊锭、分組矩陣弧轧、差異比較矩陣 至此獲得了差異分析矩陣nrDEG 2 繪圖 2.1 熱圖 可以查看到...
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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】三雪侥、表達(dá)矩陣代碼參考： 1 構(gòu)建新矩陣 圖1 全部數(shù)據(jù)的箱線圖，整體數(shù)據(jù)表達(dá)量在一條線上精绎，表明可以比較 圖2 檢查樣本分布是否有問題 2 回到GSE4287...
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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】二速缨、ID轉(zhuǎn)換相關(guān)原始代碼在這里： 1 查看表達(dá)矩陣 http://www.reibang.com/p/b69f1c84ecaa[https://www.j...
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【GEO數(shù)據(jù)庫挖掘】一、了解GEO數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)下載找出文章GSE號代乃，修改后綴即可旬牲。 使用RStudio小tips：新建文件夾拷貝project文件可以在R中快速定位文件夾位置。很方便搁吓。 1 下載...