生信技能樹數(shù)據(jù)挖掘課程學習筆記

二、數(shù)據(jù)類型和向量

數(shù)據(jù)類型

• 數(shù)值型numeric：1.3涝开、2
• 字符型 character：“a”循帐、‘nn’
• 邏輯型 logical ：TRUE T、FALSE F舀武、NA

判斷數(shù)據(jù)類型的函數(shù):class( )拄养，將要判斷的內(nèi)容寫在括號里，常見報錯：引號银舱、拼寫錯誤瘪匿、大小寫

邏輯型數(shù)據(jù)

比較運算的結(jié)果是邏輯值 >, <, <=, >=, == , !=
邏輯運算 多個邏輯條件的連接與&跛梗、或|、非!

數(shù)據(jù)類型的判斷和轉(zhuǎn)換

is族函數(shù)棋弥，判斷核偿，返回值為TRUE或FALSE

is.numeric()       是否數(shù)值型數(shù)據(jù) 
is.logical()       是否邏輯型數(shù)據(jù) 
is.charactor()     是否字符型數(shù)據(jù)

as族函數(shù)實現(xiàn)數(shù)據(jù)類型之間的轉(zhuǎn)換

as.numeric()   將其他數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)換為數(shù)值型 
as.logical()   將其他數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)換為邏輯型 
as.charactor() 將其他數(shù)據(jù)類型轉(zhuǎn)換為字符型

多個數(shù)據(jù)如何組織？

數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)： 向量 顽染、數(shù)據(jù)框宪祥、矩陣、列表

數(shù)據(jù)框約等于“表格”家乘。

向量則是數(shù)據(jù)框單獨拿出的一列蝗羊，視為一個整體。

一個向量只能有一種數(shù)據(jù)類型仁锯，可以有重復值耀找。

2.1向量的生成

（1）用 c()逐一放到一起

（2）連續(xù)的數(shù)字用冒號”:”

（3）有重復的用rep(),有規(guī)律的序列用seq(),隨機數(shù)用rnorm

（4）通過組合,產(chǎn)生更為復雜的向量。 paste0(rep("gene",times=3),1:3)

2.2 對單個向量進行的操作

（1）賦值給一個變量名 = 隨意寫法 <- 規(guī)范的賦值符號

（2）簡單數(shù)學計算

（3）根據(jù)某條件進行判斷,生成邏輯值向量

（4）初級統(tǒng)計 ：max(x) 最大值业崖、min(x) 最小值野芒、mean(x) 均值、

? median(x) 中位數(shù)双炕、var(x) 方差狞悲、sd(x) 標準差、sum(x) 總和

2.3.對兩個向量的操作

（1）邏輯比較妇斤，生成等長的邏輯向量

x = c(1,3,5,1) 
y = c(3,2,5,6)
x == y 
[1] FALSE FALSE TRUE FALSE 
x %in% y #x的元素是否在y中 
[1] FALSE TRUE  TRUE FALSE 

（2）數(shù)學計算 x+y [1] 4 5 10 7

（3）連接 paste(x,y,sep=":") [1] "1:3" "3:2" "5:5" "1:1"

（4）交集摇锋、并集、差集 intersect(x,y)站超、union(x,y)荸恕、setdiff(x,y) #x里面有的，y沒有的

（5）x 和 y不一樣長：理解一下循環(huán)補齊 x==y 短的循環(huán)補齊死相，與前后沒有關(guān)系

paste0(rep(“gene”,3),1:3)
paste0(“gene”,1:3)

與向量x等長的邏輯值可以如何生成融求？ A、比較運算 B算撮、x %in% y C生宛、用返回結(jié)果是邏輯值向量的函數(shù)

2.4.向量篩選（取子集）[]

根據(jù)邏輯值、根據(jù)位置

2.5 如何修改向量中的某個/某些元素

取子集+賦值

2.6 簡單向量作圖

k1 = rnorm(12) 
k2 = rep(c("a","b","c","d"),each = 3) 
plot(k1) 
boxplot(k1~k2)

向量的幾個進階小問題

1.兩個不同類型的向量合并在一起會怎么樣肮柜？

2.如何將兩個向量合到一起陷舅，組成一個長向量？

x=c(1,3,5)
y=c(2,3,4)
test=c(x,y)
test
## [1] 1 3 5 2 3 4

3.如何在向量首/尾/中間某位置增加一個元素素挽？

x=c(3,x)
x=c(x,4)

如何在向量第n位增加一個元素蔑赘？

n=3
x=c(1,3,5,8,6)
x
## [1] 1 3 5 8 6
y=c(x[1:n-1],7,x[n:length(x)])
y
## [1] 1 3 7 5 8 6

寫成函數(shù)

join <- function(x,n,y){
  c(x[1:n-1],y,x[n:length(x)])
}
x=c(1,3,5,8,6)
join(x,3,7)
## [1] 1 3 7 5 8 6

4.如果向量x和y內(nèi)容一致但順序不一致狸驳，如何按照x的順序排列y预明？

x=letters[1:5]
y=letters[c(3,1,2,5,4)]
match(x,y)
## [1] 2 3 1 5 4
y[match(x,y)]
## [1] "a" "b" "c" "d" "e"

向量排序-match缩赛、rank、order撰糠、sort酥馍、rev

1. sort 從小到大
2. rev 倒序排列
3. rank 返回秩次
4. order 從小到大的值的位置（最小的值在哪個位置，次小的又在哪個）
5. match(x,y)按照x的順序來排y