如果想在生物信息學(xué)專業(yè)雜志上發(fā)一篇不用做任何具體生物信息分析的文章，應(yīng)該怎么做纱烘？最近發(fā)表在 Bioinformatics 的一篇文章或許可以給你一點(diǎn)思路。
隨著生物信息的發(fā)展欣簇，生物信息學(xué)相關(guān)的文章近10年呈現(xiàn)大量增加的趨勢(shì)常空。世間萬(wàn)物皆可比較，你有沒(méi)有想過(guò)，生物信息發(fā)文章哪家強(qiáng)答姥。（山東技校找藍(lán)翔铣除？）
一句話介紹
BIOLITMAP ：一個(gè)基于地理位置，允許按照年份鹦付、雜志和主題輕松篩選查看生物信息學(xué)文章發(fā)表情況的網(wǎng)站蝎困。
略加介紹英文版
Motivation: The fast growth of bioinformatics adds a significant difficulty to assess the contribution, geographical and thematic distribution of the research publications.
Results: To help researchers, grant agencies and general public to assess the progress in bioinformatics, we have developed BIOLITMAP, a web-based geolocation system that allows an easy and sensible exploration of the publications by institution, year and topic.
Availability: BIOLITMAP is available at http://socialanalytics.bsc.es/biolitmap and the sources have been deposited at https://github.com/inab/BIOLITMAP
詳細(xì)介紹舉例版
最近，來(lái)自西班牙的研究團(tuán)隊(duì)在 Bioinformatics 發(fā)表了一篇文章向大家介紹了一個(gè)網(wǎng)站吼旧，這個(gè)網(wǎng)站統(tǒng)計(jì)了2005年-2017年發(fā)表在 Bioinformatics
OUP, BMC Bioinformatics, BMC Genomics, PLoS Computational
Biology, 和 Nucleic Acids Research 這五篇雜志的一共 46,552 篇文章捡硅。從選擇的雜志來(lái)看，確實(shí)都是偏生物信息的雜志祈噪，很多綜合類雜志或者生物類雜志涉及到大量生物信息分析的文章都沒(méi)有考慮泽铛。
在此基礎(chǔ)上網(wǎng)站開(kāi)發(fā)者把這些文章按照發(fā)表機(jī)構(gòu)所在的地理位置，發(fā)表年份和雜志以及主題進(jìn)行了詳細(xì)的分類辑鲤，包括 DNA, Functional genomics, Mapping,
Molecular genetics, Pharmacogenomics, Phylogeny, Proteomics, RNA,
Sequence analysis, Structure analysis, Tools, Transcriptomics 和 Molecular interactions, Pathways and Networks 這13個(gè)類別盔腔。
基于地理位置
首先來(lái)看看這個(gè)地球文章發(fā)表的整體情況，嗯月褥，和經(jīng)濟(jì)發(fā)展應(yīng)該比較正相關(guān)弛随，主要還是集中在北美和歐洲。
當(dāng)然吓坚，還是忍不住點(diǎn)開(kāi)我們國(guó)家看看幾個(gè)「大紅點(diǎn)」都是那里撵幽，把地圖局部放大。不出意外礁击，北上廣紅了盐杂，但是哈爾濱也紅了，武漢也紅了哆窿。不知道你能不能猜出這兩個(gè)地方是因?yàn)槭裁炊t链烈，在這里簡(jiǎn)單劇透一下，如果再放大一點(diǎn)哈爾濱有兩個(gè)紅點(diǎn)挚躯，其中一個(gè)是哈工大强衡，另一個(gè)則是哈爾濱醫(yī)科大學(xué)（國(guó)內(nèi)很早開(kāi)設(shè)生物信息學(xué)本科專業(yè)的學(xué)校）；武漢只有一個(gè)紅點(diǎn)码荔，你覺(jué)得應(yīng)該是武漢大學(xué)還是華中科技大學(xué)漩勤，嗯，是華中農(nóng)業(yè)大學(xué)（其實(shí)武大和華中科技是兩個(gè)黃色點(diǎn)）缩搅。
目光再聚焦到魔都和帝都看一看越败。在魔都有四個(gè)機(jī)構(gòu)上榜，三個(gè)知名高校復(fù)旦交大同濟(jì)再加上中科院上海生科院硼瓣，而在四個(gè)地方中究飞，上海生科院是發(fā)表文章最多的。在帝都則有7個(gè)地方被標(biāo)注為紅色，中科院（所有中科院系統(tǒng)的文章都會(huì)算在這里一份）和清華北大自然不必說(shuō)亿傅，但是其它幾個(gè)你不一定能猜的出來(lái)媒峡，它們是：中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院、中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院葵擎、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)和北京基因組研究所谅阿。而在臺(tái)灣省，也有 6 個(gè)機(jī)構(gòu)是紅色坪蚁，僅次于帝都奔穿。
查看具體信息
讓我們把目光移回到哈爾濱醫(yī)科大學(xué)镜沽，點(diǎn)擊紅點(diǎn)就可以查看具體的文章發(fā)表信息敏晤。
柱狀圖不同的顏色代表不同的雜志，其中藍(lán)色代表的雜志是 NAR 缅茉，推測(cè)其它醫(yī)學(xué)類相關(guān)的機(jī)構(gòu)應(yīng)該也是類似情況嘴脾。針對(duì)人類和醫(yī)學(xué)大量的數(shù)據(jù)，做數(shù)據(jù)庫(kù)和數(shù)據(jù)整合或許是個(gè)不錯(cuò)的選擇蔬墩。
設(shè)置篩選條件
如果感興趣译打，還可以在網(wǎng)頁(yè)右上方選定具體的篩選條件進(jìn)行過(guò)濾，例如年份或者主題拇颅。你可以選定 NAR 推測(cè)一下哪些地方可能更加偏愛(ài)發(fā)表數(shù)據(jù)庫(kù)相關(guān)的工具或者文章奏司，或者選定Tools 看哪里發(fā)表的工具更多。
查看具體文章
每一個(gè)位置查看詳細(xì)信息時(shí)都可以進(jìn)一步查看具體文章鏈接樟插，可以按照年份或者雜志排序韵洋。如果覺(jué)得沒(méi)什么文章可看，這里應(yīng)該會(huì)有不少供你選擇黄锤，當(dāng)然搪缨，還可以打印出來(lái)慢慢品味。
最后鸵熟，作者把所有數(shù)據(jù)都放到了 GitHub 上副编，你也可以進(jìn)一步自行探索。
