clustalw使用
# 安裝
conda install -c bioconda clustalw
# 使用交互式
clustalw # 啟動(dòng)程序,按照指令選擇輸出和參數(shù)
clustalw format 輸出格式
1:第一行 header line
2:允許空行
3:序列名和序列之間至少6個(gè)空格隔開(kāi),空格數(shù)取決于最長(zhǎng)的序列名
4:比對(duì)塊的最后一行無(wú)ID能真,是位點(diǎn)的保守性程度
*-- match
: -- conserved substitutions
. -- semi-conserved substitutions
-- no match