“Venn圖是我們科學(xué)研究中常用的圖形之一，今天小編給小伙伴們介紹四種Venn圖繪制工具咧虎，小伙伴根據(jù)自己的要求進(jìn)行選擇卓缰，如果小伙伴覺(jué)得對(duì)你有幫助，歡迎轉(zhuǎn)發(fā)與收藏砰诵≌骰＃”
01—數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
關(guān)注《生信學(xué)霸》，后臺(tái)回復(fù)“Venn圖”獲取測(cè)試數(shù)據(jù)茁彭，如下圖所示：
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拿著數(shù)據(jù)快跟著小編一起學(xué)習(xí)一下這個(gè)工具
02—使用方法
方法一：Sangbox云平臺(tái)繪制
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1.1__輸入?yún)?shù)总寒，如下圖所示
網(wǎng)址導(dǎo)航
http://sangerbox.com/Tool 點(diǎn)擊“韋恩圖快速繪制工具”
1.2__特別注意點(diǎn)
1. 如果是以文件的格式將數(shù)據(jù)導(dǎo)入到云平臺(tái)，平臺(tái)默認(rèn)無(wú)法讀取Excel中的數(shù)據(jù)理肺，必須將Excel文件轉(zhuǎn)為以制表位符分割的文本文件摄闸，否則小工具將無(wú)法運(yùn)行。
2.將文件從本地上傳到網(wǎng)站上應(yīng)注意文件名只能用字母妹萨、數(shù)字或下劃線(xiàn)命名不能有空格等特殊字符命名年枕，否則將上傳失敗。
1.3__結(jié)果展示
1.4__優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn)—中文圖形化交互式分析界面眠副，不需要編程画切，快速出圖，支持多種主流期刊圖形配色囱怕；
缺點(diǎn)—內(nèi)置圖形顏色庫(kù)不是很豐富霍弹，可以使用Illustrator對(duì)顏色進(jìn)行更改。
方法二：R語(yǔ)言
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1.1__繪圖步驟
# 安裝R包if (!requireNamespace("VennDiagram", quietly = TRUE)) install.packages("VennDiagram",repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")if (!requireNamespace("ggplot2", quietly = TRUE)) install.packages("ggplot2",repos = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")# 加載R包library(VennDiagram, quietly=TRUE)library(ggplot2, quietly=TRUE)# 讀入數(shù)據(jù)exp = read.csv('./veen_map.txt',header = T,sep='\t',check.names = F)# 繪圖venn<- venn.diagram(list(A=na.omit(exp$A),B=na.omit(exp$B),C=na.omit(exp$C),D=na.omit(exp$D)), filename=NULL,fill = c("cornflowerblue", "green", "yellow", "darkorchid1"), col = "black",alpha = 0.4, cat.cex = 1.5,rotation.degree = 0)# 展示圖形grid.draw(venn)# 保存圖片ggplot2::ggsave(filename = './venn.pdf',plot = venn,width = 6,height = 6,device = cairo_pdf)
1.2__結(jié)果展示
1.3__優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn)—能夠隨心所欲的修改圖形的顏色和樣式娃弓；
缺點(diǎn)—對(duì)于編程初學(xué)者典格，用R語(yǔ)言讀入數(shù)據(jù)和進(jìn)行數(shù)據(jù)變過(guò)程中會(huì)報(bào)錯(cuò)，函數(shù)參數(shù)看不懂需要很長(zhǎng)時(shí)間台丛，繪圖效率低下耍缴，一旦遇到報(bào)錯(cuò)，不能快速的解決報(bào)錯(cuò)挽霉。
方法三：Venny2.0
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1.1__輸入?yún)?shù)防嗡，結(jié)果展示
網(wǎng)址導(dǎo)航
https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/
如下圖所示：
1.2__優(yōu)缺點(diǎn)
優(yōu)點(diǎn)—不需要注冊(cè)，能夠顯示每個(gè)部分交集的百分比
缺點(diǎn)—不支持四組以上數(shù)據(jù)venn圖的繪制侠坎，需要手動(dòng)的將每組數(shù)據(jù)粘貼到數(shù)據(jù)庫(kù)蚁趁，需要自動(dòng)去表頭，圖形配色方案單一实胸。
