R可視化——基于beeswarm包繪制蜜蜂圖(beeswarm plot)

蜜蜂圖(beeswarm plot)是一種與“抖動圖”相似的散點圖聊替,這種圖可以直觀地展現(xiàn)每一個樣本的具體情況及整體的情況按灶。

安裝肺孤、加載R包

#安裝包
install.packages("beeswarm")
#加載包
library(beeswarm)

數(shù)據(jù)

set.seed(12)
df<-data.frame(
  x=rnorm(1000),
  group1=sample(c("G1", "G2", "G3"),
               size = 100, replace = TRUE),
  group2=as.numeric(factor(sample(c("Yes", "No"),
                                 size = 100, replace = TRUE))))
head(df)#預覽數(shù)據(jù)
image.png

繪圖

1眶拉、基礎繪圖
beeswarm(df$x~df$group1)
image.png
2千埃、個性化繪制
beeswarm(df$x~df$group1,#指定數(shù)據(jù)
         pch=19,#指定點的形狀
         col=c("#3FA0FF", "#FFE099", "#F76D5E"),#指定顏色
         method = "swarm",#指定數(shù)據(jù)點排列方式,可選擇"swarm"忆植、"center"放可、"hex"、"square"
         corral = "gutter",#調(diào)整數(shù)據(jù)點以防止組數(shù)據(jù)重疊朝刊,可選擇有"none"耀里、"gutter"、"wrap"拾氓、"random"冯挎、"omit"
         side=0,#位置蜂群顯示方向,有-1咙鞍,0房官,1可選擇
         priority = "descending"#布局順序,可選擇"descending"续滋、"random"翰守、"density"、"none"
         )
image.png
3疲酌、加入子群體
beeswarm(df$x~df$group1,#指定數(shù)據(jù)
         pch=19,#點的形狀
         pwcol=df$group2,#指定子群體
         method = "swarm",#指定數(shù)據(jù)點排列方式蜡峰,可選擇"swarm"、"center"徐勃、"hex"事示、"square"
         corral = "gutter",#調(diào)整數(shù)據(jù)點以防止組數(shù)據(jù)重疊,可選擇有"none"僻肖、"gutter"肖爵、"wrap"、"random"臀脏、"omit"
         side=0,#位置蜂群顯示方向劝堪,有-1冀自,0,1可選擇
         priority = "descending"#布局順序秒啦,可選擇"descending"熬粗、"random"、"density"余境、"none"
         )
#圖例
legend("topright", legend = c("Yes", "No"),
       col = 1:2, pch = 19)
image.png
參考:https://r-charts.com/distribution/beeswarm/
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