Spring Boot引起的“堆外內存泄漏”排查及經驗總結

背景

為了更好地實現(xiàn)對項目的管理哪轿,我們將組內一個項目遷移到MDP框架(基于Spring Boot)蹂午,隨后我們就發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)會頻繁報出Swap區(qū)域使用量過高的異常坡垫。筆者被叫去幫忙查看原因,發(fā)現(xiàn)配置了4G堆內內存画侣,但是實際使用的物理內存竟然高達7G冰悠,確實不正常。JVM參數(shù)配置是“-XX:MetaspaceSize=256M -XX:MaxMetaspaceSize=256M -XX:+AlwaysPreTouch -XX:ReservedCodeCacheSize=128m -XX:InitialCodeCacheSize=128m, -Xss512k -Xmx4g -Xms4g,-XX:+UseG1GC -XX:G1HeapRegionSize=4M”配乱,實際使用的物理內存如下圖所示:

top命令顯示的內存情況

top命令顯示的內存情況

排查過程

1. 使用Java層面的工具定位內存區(qū)域(堆內內存溉卓、Code區(qū)域或者使用unsafe.allocateMemory和DirectByteBuffer申請的堆外內存)

筆者在項目中添加-XX:NativeMemoryTracking=detailJVM參數(shù)重啟項目皮迟,使用命令jcmd pid VM.native_memory detail查看到的內存分布如下:

jcmd顯示的內存情況

jcmd顯示的內存情況

發(fā)現(xiàn)命令顯示的committed的內存小于物理內存,因為jcmd命令顯示的內存包含堆內內存桑寨、Code區(qū)域伏尼、通過unsafe.allocateMemory和DirectByteBuffer申請的內存,但是不包含其他Native Code(C代碼)申請的堆外內存尉尾。所以猜測是使用Native Code申請內存所導致的問題爆阶。

為了防止誤判,筆者使用了pmap查看內存分布沙咏,發(fā)現(xiàn)大量的64M的地址辨图;而這些地址空間不在jcmd命令所給出的地址空間里面,基本上就斷定就是這些64M的內存所導致肢藐。

pmap顯示的內存情況

pmap顯示的內存情況

2. 使用系統(tǒng)層面的工具定位堆外內存

因為筆者已經基本上確定是Native Code所引起故河,而Java層面的工具不便于排查此類問題,只能使用系統(tǒng)層面的工具去定位問題吆豹。

首先鱼的,使用了gperftools去定位問題

gperftools的使用方法可以參考gperftools,gperftools的監(jiān)控如下:

gperftools監(jiān)控

gperftools監(jiān)控

從上圖可以看出:使用malloc申請的的內存最高到3G之后就釋放了痘煤,之后始終維持在700M-800M凑阶。筆者第一反應是:難道Native Code中沒有使用malloc申請,直接使用mmap/brk申請的衷快?(gperftools原理就使用動態(tài)鏈接的方式替換了操作系統(tǒng)默認的內存分配器(glibc)晌砾。)

然后,使用strace去追蹤系統(tǒng)調用

因為使用gperftools沒有追蹤到這些內存烦磁,于是直接使用命令“strace -f -e”brk,mmap,munmap” -p pid”追蹤向OS申請內存請求养匈,但是并沒有發(fā)現(xiàn)有可疑內存申請。strace監(jiān)控如下圖所示:

strace監(jiān)控

strace監(jiān)控

接著都伪,使用GDB去dump可疑內存

因為使用strace沒有追蹤到可疑內存申請呕乎;于是想著看看內存中的情況。就是直接使用命令gdp -pid pid進入GDB之后陨晶,然后使用命令dump memory mem.bin startAddress endAddressdump內存猬仁,其中startAddress和endAddress可以從/proc/pid/smaps中查找。然后使用strings mem.bin查看dump的內容先誉,如下:

gperftools監(jiān)控

gperftools監(jiān)控

從內容上來看湿刽,像是解壓后的JAR包信息。讀取JAR包信息應該是在項目啟動的時候褐耳,那么在項目啟動之后使用strace作用就不是很大了诈闺。所以應該在項目啟動的時候使用strace,而不是啟動完成之后铃芦。

再次雅镊,項目啟動時使用strace去追蹤系統(tǒng)調用

項目啟動使用strace追蹤系統(tǒng)調用襟雷,發(fā)現(xiàn)確實申請了很多64M的內存空間,截圖如下:

strace監(jiān)控

strace監(jiān)控

使用該mmap申請的地址空間在pmap對應如下:

strace申請內容對應的pmap地址空間

strace申請內容對應的pmap地址空間

最后仁烹,使用jstack去查看對應的線程

因為strace命令中已經顯示申請內存的線程ID耸弄。直接使用命令jstack pid去查看線程棧,找到對應的線程棧(注意10進制和16進制轉換)如下:

strace申請空間的線程棧

strace申請空間的線程棧

這里基本上就可以看出問題來了:MCC(美團統(tǒng)一配置中心)使用了Reflections進行掃包卓缰,底層使用了Spring Boot去加載JAR计呈。因為解壓JAR使用Inflater類,需要用到堆外內存征唬,然后使用Btrace去追蹤這個類捌显,棧如下:

btrace追蹤棧

btrace追蹤棧

然后查看使用MCC的地方,發(fā)現(xiàn)沒有配置掃包路徑鳍鸵,默認是掃描所有的包苇瓣。于是修改代碼尉间,配置掃包路徑偿乖,發(fā)布上線后內存問題解決。

3. 為什么堆外內存沒有釋放掉呢哲嘲?

雖然問題已經解決了贪薪,但是有幾個疑問:

  • 為什么使用舊的框架沒有問題?
  • 為什么堆外內存沒有釋放眠副?
  • 為什么內存大小都是64M画切,JAR大小不可能這么大,而且都是一樣大囱怕?
  • 為什么gperftools最終顯示使用的的內存大小是700M左右霍弹,解壓包真的沒有使用malloc申請內存嗎?

帶著疑問娃弓,筆者直接看了一下Spring Boot Loader那一塊的源碼典格。發(fā)現(xiàn)Spring Boot對Java JDK的InflaterInputStream進行了包裝并且使用了Inflater,而Inflater本身用于解壓JAR包的需要用到堆外內存台丛。而包裝之后的類ZipInflaterInputStream沒有釋放Inflater持有的堆外內存耍缴。于是筆者以為找到了原因,立馬向Spring Boot社區(qū)反饋了這個bug挽霉。但是反饋之后防嗡,筆者就發(fā)現(xiàn)Inflater這個對象本身實現(xiàn)了finalize方法,在這個方法中有調用釋放堆外內存的邏輯侠坎。也就是說Spring Boot依賴于GC釋放堆外內存蚁趁。

筆者使用jmap查看堆內對象時,發(fā)現(xiàn)已經基本上沒有Inflater這個對象了实胸。于是就懷疑GC的時候荣德,沒有調用finalize闷煤。帶著這樣的懷疑,筆者把Inflater進行包裝在Spring Boot Loader里面替換成自己包裝的Inflater涮瞻,在finalize進行打點監(jiān)控鲤拿,結果finalize方法確實被調用了。于是筆者又去看了Inflater對應的C代碼署咽,發(fā)現(xiàn)初始化的使用了malloc申請內存近顷,end的時候也調用了free去釋放內存。

此刻宁否,筆者只能懷疑free的時候沒有真正釋放內存窒升,便把Spring Boot包裝的InflaterInputStream替換成Java JDK自帶的,發(fā)現(xiàn)替換之后慕匠,內存問題也得以解決了饱须。

這時,再返過來看gperftools的內存分布情況台谊,發(fā)現(xiàn)使用Spring Boot時蓉媳,內存使用一直在增加,突然某個點內存使用下降了好多(使用量直接由3G降為700M左右)锅铅。這個點應該就是GC引起的酪呻,內存應該釋放了,但是在操作系統(tǒng)層面并沒有看到內存變化盐须,那是不是沒有釋放到操作系統(tǒng)玩荠,被內存分配器持有了呢?

繼續(xù)探究贼邓,發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)默認的內存分配器(glibc 2.12版本)和使用gperftools內存地址分布差別很明顯阶冈,2.5G地址使用smaps發(fā)現(xiàn)它是屬于Native Stack。內存地址分布如下:

gperftools顯示的內存地址分布

gperftools顯示的內存地址分布

到此塑径,基本上可以確定是內存分配器在搗鬼女坑;搜索了一下glibc 64M,發(fā)現(xiàn)glibc從2.11開始對每個線程引入內存池(64位機器大小就是64M內存)晓勇,原文如下:

glib內存池說明

glib內存池說明

按照文中所說去修改MALLOC_ARENA_MAX環(huán)境變量堂飞,發(fā)現(xiàn)沒什么效果。查看tcmalloc(gperftools使用的內存分配器)也使用了內存池方式绑咱。

為了驗證是內存池搞的鬼绰筛,筆者就簡單寫個不帶內存池的內存分配器。使用命令gcc zjbmalloc.c -fPIC -shared -o zjbmalloc.so生成動態(tài)庫描融,然后使用export LD_PRELOAD=zjbmalloc.so替換掉glibc的內存分配器铝噩。其中代碼Demo如下:

#include<sys/mman.h>
#include<stdlib.h>
#include<string.h>
#include<stdio.h>
//作者使用的64位機器良狈,sizeof(size_t)也就是sizeof(long) 
void* malloc ( size_t size )
{
   long* ptr = mmap( 0, size + sizeof(long), PROT_READ | PROT_WRITE, MAP_PRIVATE | MAP_ANONYMOUS, 0, 0 );
   if (ptr == MAP_FAILED) {
    return NULL;
   }
   *ptr = size;                     // First 8 bytes contain length.
   return (void*)(&ptr[1]);        // Memory that is after length variable
}

void *calloc(size_t n, size_t size) {
 void* ptr = malloc(n * size);
 if (ptr == NULL) {
    return NULL;
 }
 memset(ptr, 0, n * size);
 return ptr;
}
void *realloc(void *ptr, size_t size)
{
 if (size == 0) {
    free(ptr);
    return NULL;
 }
 if (ptr == NULL) {
    return malloc(size);
 }
 long *plen = (long*)ptr;
 plen--;                          // Reach top of memory
 long len = *plen;
 if (size <= len) {
    return ptr;
 }
 void* rptr = malloc(size);
 if (rptr == NULL) {
    free(ptr);
    return NULL;
 }
 rptr = memcpy(rptr, ptr, len);
 free(ptr);
 return rptr;
}

void free (void* ptr )
{
   if (ptr == NULL) {
     return;
   }
   long *plen = (long*)ptr;
   plen--;                          // Reach top of memory
   long len = *plen;               // Read length
   munmap((void*)plen, len + sizeof(long));
}

通過在自定義分配器當中埋點可以發(fā)現(xiàn)其實程序啟動之后應用實際申請的堆外內存始終在700M-800M之間触徐,gperftools監(jiān)控顯示內存使用量也是在700M-800M左右。但是從操作系統(tǒng)角度來看進程占用的內存差別很大(這里只是監(jiān)控堆外內存)。

筆者做了一下測試川背,使用不同分配器進行不同程度的掃包砂轻,占用的內存如下:

內存測試對比

內存測試對比

為什么自定義的malloc申請800M猫十,最終占用的物理內存在1.7G呢蚓再?

因為自定義內存分配器采用的是mmap分配內存,mmap分配內存按需向上取整到整數(shù)個頁一姿,所以存在著巨大的空間浪費七咧。通過監(jiān)控發(fā)現(xiàn)最終申請的頁面數(shù)目在536k個左右,那實際上向系統(tǒng)申請的內存等于512k * 4k(pagesize) = 2G叮叹。 為什么這個數(shù)據(jù)大于1.7G呢艾栋?

因為操作系統(tǒng)采取的是延遲分配的方式,通過mmap向系統(tǒng)申請內存的時候蛉顽,系統(tǒng)僅僅返回內存地址并沒有分配真實的物理內存蝗砾。只有在真正使用的時候,系統(tǒng)產生一個缺頁中斷携冤,然后再分配實際的物理Page悼粮。

總結

流程圖

流程圖

整個內存分配的流程如上圖所示。MCC掃包的默認配置是掃描所有的JAR包噪叙。在掃描包的時候矮锈,Spring Boot不會主動去釋放堆外內存霉翔,導致在掃描階段睁蕾,堆外內存占用量一直持續(xù)飆升。當發(fā)生GC的時候债朵,Spring Boot依賴于finalize機制去釋放了堆外內存子眶;但是glibc為了性能考慮,并沒有真正把內存歸返到操作系統(tǒng)序芦,而是留下來放入內存池了臭杰,導致應用層以為發(fā)生了“內存泄漏”。所以修改MCC的配置路徑為特定的JAR包谚中,問題解決渴杆。筆者在發(fā)表這篇文章時,發(fā)現(xiàn)Spring Boot的最新版本(2.0.5.RELEASE)已經做了修改宪塔,在ZipInflaterInputStream主動釋放了堆外內存不再依賴GC磁奖;所以Spring Boot升級到最新版本,這個問題也可以得到解決某筐。

參考資料

  1. GNU C Library (glibc)
  2. Native Memory Tracking
  3. Spring Boot
  4. gperftools
  5. Btrace

作者簡介

  • 紀兵比搭,2015年加入美團,目前主要從事酒店C端相關的工作南誊。

轉載:https://tech.meituan.com/2019/01/03/spring-boot-native-memory-leak.html

?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
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