1.what is RAST?
RAST(使用子系統(tǒng)技術的快速注釋)是用于注釋完整或幾乎完整的組裝的原核基因組以及完整噬菌體或質粒的一個工具，但它不能分析真核好芭，小片段的基因組承疲。 它為整個系統(tǒng)樹中的這些基因組提供了高質量的基因組注釋邻耕。
2.how to use？
RAST網站：http://rast.nmpdr.org/
(1)注冊：
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注冊完成后到郵箱查看賬號與密碼(有點慢),然后登錄纪隙。
(2)step1:上傳你要注釋的基因組文件赊豌，要求為fasta或者Genbank格式
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go to setp 2 后會生成如下的重疊群統(tǒng)計
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(3)step2:填寫基因組的信息
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Taxonomy ID(分類ID):
如果您輸入有效的NCBI分類標準ID，然后單擊“Fill in form based on NCBI taxonomy-ID”绵咱，RAST將嘗試自動填寫以下表格。如果您不知道基因組的taxonomy-ID熙兔，請將分類法ID字段留空悲伶，然后手動填寫這些字段。
Taxonomy string(分類字符串):如果留為空白住涉，RAST將根據下面的表格條目填寫“Domain; genus;species;strain”麸锉。
Domain:根據實際情況選擇。
Genus(屬)：如果不知道舆声，默認為Unknown
Species(種)：如果不知道花沉，默認為sp.
Strain:可選柳爽。
Genetic Code:如果不是下面四個選第一個。
然后go to step 3
(4) Finish the upload:下面的信息根據實際需要填碱屁，然后可以在View job status看結果(需要一定時間)
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然后view dtails就可以下載結果(支持多種格式下載)
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